RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557657.5

TMEM260-216, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM260, Length 2,572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-216ENST00000557657 HVCN1Q96D96 273 aa22.69■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 CHST7Q9NS84 486 aa22.69■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 PCYOX1Q9UHG3 505 aa22.69■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 UNGP13051 313 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 RWDD2BP57060 319 aa22.68■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 RUFY4Q6ZNE9 571 aa22.68■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 FNBP1Q96RU3 617 aa22.68■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.68■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 GARTP22102 1010 aa22.68■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 PIK3CAP42336 1068 aa22.68■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 BAG6P46379 1132 aa22.68■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 TGFB2P61812 414 aa22.68■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 PPP2R2AP63151 447 aa22.68■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 QPCTQ16769 361 aa22.68■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.68■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 MCOLN2Q8IZK6 566 aa22.68■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 OR5B17Q8NGF7 314 aa22.68■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 HEMGNQ9BXL5 484 aa22.68■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 TMEM51Q9NW97 253 aa22.68■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 FBXO40Q9UH90 709 aa22.68■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.68■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 EXTL3O43909 919 aa22.67■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 MAGEA9P43362 315 aa22.67■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 C17orf75Q9HAS0 396 aa22.67■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 GGA3Q9NZ52 723 aa22.67■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 RASAL2Q9UJF2 1139 aa22.67■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 ARID2Q68CP9 1835 aa22.67■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 MAFGO15525 162 aa22.67■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 GJC1P36383 396 aa22.67■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 XKR3Q5GH77 459 aa22.67■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 TREML2Q5T2D2 321 aa22.67■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.67■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 PACS2Q86VP3 889 aa22.67■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 KLRG1Q96E93 195 aa22.67■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 C11orf70Q9BRQ4 267 aa22.67■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 UVRAGQ9P2Y5 699 aa22.67■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 DOCK1Q14185 1865 aa22.67■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 GCNT1Q02742 428 aa22.66■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 ZACNQ401N2 412 aa22.66■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 TMEM270Q6UE05 265 aa22.66■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 PWWP2AQ96N64 755 aa22.66■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 ZNF302Q9NR11 478 aa22.66■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 PRUNE1Q86TP1 453 aa22.66■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 MICALL1Q8N3F8 863 aa22.66■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 AZI2Q9H6S1 392 aa22.66■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 FDX1P10109 184 aa22.65■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 GTF2H1P32780 548 aa22.65■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 VPS41P49754 854 aa22.65■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 PPP2R5EQ16537 467 aa22.65■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.65■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 GINM1Q9NU53 330 aa22.65■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 TP73O15350 636 aa22.65■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 STRN3Q13033 797 aa22.65■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 GNPTABQ3T906 1256 aa22.65■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 AGBL2Q5U5Z8 902 aa22.65■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 DENND2CQ68D51 928 aa22.65■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa22.65■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 RAPGEF5Q92565 580 aa22.65■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 KLHL11Q9NVR0 708 aa22.65■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 NFASCO94856 1347 aa22.65■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 FOXO6A8MYZ6 492 aa22.64■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 K7ERI5 159 aa22.64■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 OATP04181 439 aa22.64■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 ACO1P21399 889 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 TNFSF9P41273 254 aa22.64■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 PSMD6Q15008 389 aa22.64■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 PPP1R7Q15435 360 aa22.64■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 SGO2Q562F6 1265 aa22.64■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 DEPTORQ8TB45 409 aa22.64■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 PCYT2Q99447 389 aa22.64■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.64■■□□□ 1.22
TMEM260-216ENST00000557657 FZD9O00144 591 aa22.64■■□□□ 1.21
TMEM260-216ENST00000557657 ERLIN2O94905 339 aa22.64■■□□□ 1.21
TMEM260-216ENST00000557657 CCDC38Q502W7 563 aa22.64■■□□□ 1.21
TMEM260-216ENST00000557657 WDR44Q5JSH3 913 aa22.64■■□□□ 1.21
TMEM260-216ENST00000557657 TMEM130Q8N3G9 435 aa22.64■■□□□ 1.21
TMEM260-216ENST00000557657 C12orf42Q96LP6 360 aa22.64■■□□□ 1.21
TMEM260-216ENST00000557657 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.64■■□□□ 1.21
TMEM260-216ENST00000557657 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.64■■□□□ 1.21
TMEM260-216ENST00000557657 USTQ9Y2C2 406 aa22.64■■□□□ 1.21
TMEM260-216ENST00000557657 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa22.64■■□□□ 1.21
TMEM260-216ENST00000557657 DRG2P55039 364 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
TMEM260-216ENST00000557657 KRT17Q04695 432 aa22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms