RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555806.5

NEDD1-208, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-208ENST00000555806 CNTN3Q9P232 1028 aa20.12■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 TBX20Q9UMR3 447 aa20.12■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 CITO14578 2027 aa20.11■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 TGM5O43548 720 aa20.11■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 KCNE1P15382 129 aa20.11■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 SCP2P22307 547 aa20.11■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 UPP1Q16831 310 aa20.11■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 PDXDC1Q6P996 788 aa20.11■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 CCDC149Q6ZUS6 474 aa20.11■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 DYMQ7RTS9 669 aa20.11■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 EDAQ92838 391 aa20.11■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 MYH15Q9Y2K3 1946 aa20.11■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa20.1■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 PODXLO00592 558 aa20.1■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 TRAPPC3O43617 180 aa20.1■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 RFPL2O75678 378 aa20.1■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 NMT1P30419 496 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 ZXDAP98168 799 aa20.1■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa20.1■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa20.1■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 SV2BQ7L1I2 683 aa20.1■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 HDAC7Q8WUI4 952 aa20.1■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 KCNN1Q92952 543 aa20.1■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 HAPLN2Q9GZV7 340 aa20.1■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa20.1■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa20.1■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 I3L4J1 428 aa20.09■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 C1RP00736 705 aa20.09■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 CXCL8P10145 99 aa20.09■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 ABCD1P33897 745 aa20.09■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 STAT6P42226 847 aa20.09■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 BRCC3P46736 316 aa20.09■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 PTPN21Q16825 1174 aa20.09■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 SLC10A6Q3KNW5 377 aa20.09■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 KREMEN2Q8NCW0 462 aa20.09■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 C3orf58Q8NDZ4 430 aa20.09■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 CLSTN3Q9BQT9 956 aa20.09■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 PANK2Q9BZ23 570 aa20.09■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 DENND4AQ7Z401 1863 aa20.09■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 C2orf16Q68DN1 1984 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 VWA8A3KMH1 1905 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 PIGRP01833 764 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 CLTAP09496 248 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 FGFR3P22607 806 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 TKTP29401 623 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 KYAT1Q16773 422 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 LILRA6Q6PI73 481 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 CD300LGQ6UXG3 332 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 SFR1Q86XK3 245 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 LINC00301Q8NCQ3 95 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 DDX12PQ92771 950 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 FIZ1Q96SL8 496 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 PIDD1Q9HB75 910 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 USTQ9Y2C2 406 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 NUB1Q9Y5A7 615 aa20.08■□□□□ 0.81
NEDD1-208ENST00000555806 MYMKA6NI61 221 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD1-208ENST00000555806 SPTLC2O15270 562 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD1-208ENST00000555806 RPL9P32969 192 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
NEDD1-208ENST00000555806 TNFSF9P41273 254 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD1-208ENST00000555806 GTF2BQ00403 316 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD1-208ENST00000555806 PPP2R3AQ06190 1150 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD1-208ENST00000555806 SPAG1Q07617 926 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD1-208ENST00000555806 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
NEDD1-208ENST00000555806 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
NEDD1-208ENST00000555806 LIN9Q5TKA1 542 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD1-208ENST00000555806 CYP26C1Q6V0L0 522 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD1-208ENST00000555806 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
NEDD1-208ENST00000555806 TRIM67Q6ZTA4 783 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD1-208ENST00000555806 OTOP3Q7RTS5 596 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD1-208ENST00000555806 MAP4K3Q8IVH8 894 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD1-208ENST00000555806 PLCD3Q8N3E9 789 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD1-208ENST00000555806 PDILTQ8N807 584 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD1-208ENST00000555806 MSTO1Q9BUK6 570 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD1-208ENST00000555806 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD1-208ENST00000555806 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD1-208ENST00000555806 FBXW11Q9UKB1 542 aa20.07■□□□□ 0.8
NEDD1-208ENST00000555806 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
NEDD1-208ENST00000555806 OGTO15294 1046 aa20.06■□□□□ 0.8
NEDD1-208ENST00000555806 ADAM12O43184 909 aa20.06■□□□□ 0.8
NEDD1-208ENST00000555806 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
NEDD1-208ENST00000555806 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
NEDD1-208ENST00000555806 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa20.06■□□□□ 0.8
NEDD1-208ENST00000555806 HFE2Q6ZVN8 426 aa20.06■□□□□ 0.8
NEDD1-208ENST00000555806 ANKS3Q6ZW76 656 aa20.06■□□□□ 0.8
NEDD1-208ENST00000555806 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms