RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 LCP1P13796 627 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SULT1E1P49888 294 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SLC26A2P50443 739 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 NNTQ13423 1086 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 NCOA4Q13772 614 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 CCL15Q16663 113 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 HIF1AQ16665 826 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 KCTD16Q68DU8 428 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 CALML6Q8TD86 181 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SH3KBP1Q96B97 665 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SLITRK1Q96PX8 696 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 AGPAT1Q99943 283 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM8AQ9HCN3 771 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 CHUKO15111 745 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 CSPG5O95196 566 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 MYCP01106 439 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 EFHC1Q5JVL4 640 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 MICAL3Q7RTP6 2002 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 TNIP2Q8NFZ5 429 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 AIFM3Q96NN9 605 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 MYH4Q9Y623 1939 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 CDH6P55285 790 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 EPHA10Q5JZY3 1008 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SLC44A5Q8NCS7 719 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 LINC00116Q8NCU8 138 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 CATSPER1Q8NEC5 780 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 CDC26Q8NHZ8 85 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 KLHL29Q96CT2 875 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 EGFL8Q99944 293 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM260Q9NX78 707 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 NMT2O60551 498 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC22O60826 627 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 AKR1B1P15121 316 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 CHRNA5P30532 468 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ZBTB17Q13105 803 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SZRD1Q7Z422 152 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 FBXO33Q7Z6M2 555 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ATPAF2Q8N5M1 289 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 RNF217Q8TC41 542 aa6.75□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 LRRC53A6NM62 1247 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SPAG6O75602 509 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 EGFRP00533 1210 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 GARTP22102 1010 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ARHGEF7Q14155 803 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SLFNL1Q499Z3 407 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 TRPC7Q9HCX4 862 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 GTSE1Q9NYZ3 720 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 HSPBP1Q9NZL4 362 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 PRR12Q9ULL5 1215 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 DOLKQ9UPQ8 538 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 C17orf102A2RUQ5 167 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 PSMD14O00487 310 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 TLR2O60603 784 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 NDUFB10O96000 172 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 GTF2H1P32780 548 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 RGS4P49798 205 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 PMS2P54278 862 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 PPP4CP60510 307 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 EDRF1Q3B7T1 1238 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF484Q5JVG2 852 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ATF7IP2Q5U623 682 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 LINC00523Q86TU6 105 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 RMDN1Q96DB5 314 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ARHGEF26Q96DR7 871 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SCOCQ9UIL1 159 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ITM2BQ9Y287 266 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 CFAP69A5D8W1 941 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ADORA2BP29275 332 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 NPEPPSP55786 919 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SLC7A5Q01650 507 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 PLD1Q13393 1074 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM132BQ14DG7 1078 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC144BQ3MJ40 725 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ATL2Q8NHH9 583 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 MKNK1Q9BUB5 465 aa6.74□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa6.74□□□□□ -1.33
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