RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545015.1

POLE-222, Transcript of DNA polymerase epsilon, catalytic subunit, human

TSL 2

Gene POLE, Length 366 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLE-222	ENST00000545015	PRR33	A8MZF0	331 aa		14.64	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015		K7ENM7	598 aa		14.64	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	SPTLC2	O15270	562 aa		14.64	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	PPP1R37	O75864	691 aa		14.64	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	B3GAT3	O94766	335 aa		14.64	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	CLCNKB	P51801	687 aa		14.64	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	OSTN	P61366	133 aa		14.64	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	STK38	Q15208	465 aa		14.64	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		14.64	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	SV2B	Q7L1I2	683 aa		14.64	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		14.64	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	DDX12P	Q92771	950 aa		14.64	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	HVCN1	Q96D96	273 aa		14.64	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		14.64	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	B3GALT6	Q96L58	329 aa		14.64	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	APOL5	Q9BWW9	433 aa		14.64	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		14.64	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		14.64	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		14.64	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	NR2E1	Q9Y466	385 aa		14.64	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		14.64	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015		A0A087X0B3	334 aa		14.63	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	MYMK	A6NI61	221 aa		14.63	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	OGT	O15294	1046 aa		14.63	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	TGM5	O43548	720 aa		14.63	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	TRAPPC3	O43617	180 aa		14.63	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	F13A1	P00488	732 aa		14.63	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	GAP43	P17677	238 aa		14.63	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	LIG4	P49917	911 aa		14.63	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	ZBTB6	Q15916	424 aa		14.63	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		14.63	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		14.63	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	HASPIN	Q8TF76	798 aa		14.63	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	EDA	Q92838	391 aa		14.63	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		14.63	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		14.63	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		14.63	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	MTRR	Q9UBK8	725 aa		14.63	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		14.63	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	CDH22	Q9UJ99	828 aa		14.63	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		14.63	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	MYH11	P35749	1972 aa		14.63	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	PODXL	O00592	558 aa		14.62	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	CUTA	O60888	179 aa		14.62	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	CYP3A5	P20815	502 aa		14.62	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	LRPAP1	P30533	357 aa		14.62	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	E2F4	Q16254	413 aa		14.62	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	PSMD5	Q16401	504 aa		14.62	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	KANK3	Q6NY19	840 aa		14.62	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		14.62	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		14.62	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	RTL10	Q7L3V2	364 aa		14.62	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	CD302	Q8IX05	232 aa		14.62	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	BICD1	Q96G01	975 aa		14.62	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	CUEDC2	Q9H467	287 aa		14.62	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		14.62	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		14.61	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	SYN3	O14994	580 aa		14.61	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	POU2F2	P09086	479 aa		14.61	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	CXCL8	P10145	99 aa		14.61	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	COL9A1	P20849	921 aa		14.61	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	14.61	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	HOXA9	P31269	272 aa		14.61	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	STAT6	P42226	847 aa		14.61	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	ALCAM	Q13740	583 aa		14.61	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	RAB33A	Q14088	237 aa		14.61	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	PTPN21	Q16825	1174 aa		14.61	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	14.61	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		14.61	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		14.61	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		14.61	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	DYM	Q7RTS9	669 aa		14.61	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		14.61	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	SFR1	Q86XK3	245 aa		14.61	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		14.61	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		14.61	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		14.61	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	14.61	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	TNMD	Q9H2S6	317 aa		14.61	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		14.61	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		14.61	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		14.6	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	TBC1D4	O60343	1298 aa		14.6	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	ZMYND10	O75800	440 aa		14.6	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	14.6	□□□□□ -0.07
POLE-222	ENST00000545015	WEE2	P0C1S8	567 aa		14.6	□□□□□ -0.07

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