RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542337.5

DDB1-220, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene DDB1, Length 558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1-220ENST00000542337 RPL9P32969 192 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 ABCD1P33897 745 aa22.12■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 TDGQ13569 410 aa22.12■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 PPM1LQ5SGD2 360 aa22.12■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 ANKS3Q6ZW76 656 aa22.12■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 FEZF2Q8TBJ5 459 aa22.12■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 PARVGQ9HBI0 331 aa22.12■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 CNTN3Q9P232 1028 aa22.12■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 IGSF9Q9P2J2 1179 aa22.12■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 FBXW11Q9UKB1 542 aa22.12■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.12■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 PODXLO00592 558 aa22.11■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 TBCAO75347 108 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 PAPLNO95428 1278 aa22.11■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 PLCG1P19174 1290 aa22.11■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 NCKAP1LP55160 1127 aa22.11■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 RAB33AQ14088 237 aa22.11■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 KARSQ15046 597 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 KYAT1Q16773 422 aa22.11■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 HAUS6Q7Z4H7 955 aa22.11■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 RAD54LQ92698 747 aa22.11■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 REEP2Q9BRK0 252 aa22.11■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 BACH2Q9BYV9 841 aa22.11■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 MFSD1Q9H3U5 465 aa22.11■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.11■■□□□ 1.13
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DDB1-220ENST00000542337 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.11■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
DDB1-220ENST00000542337 ABLIM1O14639 778 aa22.1■■□□□ 1.13
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DDB1-220ENST00000542337 MCL1Q07820 350 aa22.1■■□□□ 1.13
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DDB1-220ENST00000542337 MTRRQ9UBK8 725 aa22.1■■□□□ 1.13
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DDB1-220ENST00000542337 K7ENM7 598 aa22.09■■□□□ 1.13
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DDB1-220ENST00000542337 SYT1P21579 422 aa22.09■■□□□ 1.13
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DDB1-220ENST00000542337 RTL10Q7L3V2 364 aa22.09■■□□□ 1.13
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DDB1-220ENST00000542337 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
DDB1-220ENST00000542337 MYADMQ96S97 322 aa22.07■■□□□ 1.12
DDB1-220ENST00000542337 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa22.07■■□□□ 1.12
DDB1-220ENST00000542337 SMOC2Q9H3U7 446 aa22.07■■□□□ 1.12
DDB1-220ENST00000542337 DUSP12Q9UNI6 340 aa22.07■■□□□ 1.12
DDB1-220ENST00000542337 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
DDB1-220ENST00000542337 MUC6Q6W4X9 2439 aa22.07■■□□□ 1.12
DDB1-220ENST00000542337 XPOTO43592 962 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
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