RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540101.2

C16orf62-211, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 461 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-211ENST00000540101 CGRRF1Q99675 332 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 ASB7Q9H672 318 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 TMEM161AQ9NX61 479 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 TAB2Q9NYJ8 693 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 PLAGL2Q9UPG8 496 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 C2CD2Q9Y426 696 aa8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 CHD9Q3L8U1 2897 aa8.48□□□□□ -1.05
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C16orf62-211ENST00000540101 B4GALT3O60512 393 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 OFD1O75665 1012 aa8.48□□□□□ -1.05
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C16orf62-211ENST00000540101 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
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C16orf62-211ENST00000540101 FANCCQ00597 558 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 PPP2R3AQ06190 1150 aa8.48□□□□□ -1.05
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C16orf62-211ENST00000540101 NR1I3Q14994 352 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 ZACNQ401N2 412 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 CCDC40Q4G0X9 1142 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 VWA3BQ502W6 1294 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 JADE1Q6IE81 842 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 WDR49Q8IV35 697 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 CD302Q8IX05 232 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 TMEM130Q8N3G9 435 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 LMO3Q8TAP4 145 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 HERVK_113Q902F9 699 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 CCDC127Q96BQ5 260 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 TMEM117Q9H0C3 514 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 NDST4Q9H3R1 872 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 PRDM12Q9H4Q4 367 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 GRPEL1Q9HAV7 217 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 GIT1Q9Y2X7 761 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 DERAQ9Y315 318 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 COQ4Q9Y3A0 265 aa8.48□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
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C16orf62-211ENST00000540101 EFCAB14O75071 495 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 VNN1O95497 513 aa8.47□□□□□ -1.05
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C16orf62-211ENST00000540101 FGFR1P11362 822 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 ITGA4P13612 1032 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 KRT13P13646 458 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 GTF2H1P32780 548 aa8.47□□□□□ -1.05
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C16orf62-211ENST00000540101 GCLMP48507 274 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 FMO5P49326 533 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 TPM4P67936 248 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 DEFB103AP81534 67 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 DSC1Q08554 894 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 KCNH2Q12809 1159 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 SURF1Q15526 300 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 EPC2Q52LR7 807 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 SV2AQ7L0J3 742 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 OTOP2Q7RTS6 562 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 NT5DC4Q86YG4 428 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 NPAS4Q8IUM7 802 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 C1orf127Q8N9H9 656 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 TOP1MTQ969P6 601 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 PGBD4Q96DM1 585 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 TSPAN18Q96SJ8 248 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 GAD1Q99259 594 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 APOL6Q9BWW8 343 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 MTMR12Q9C0I1 747 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 RSAD1Q9HA92 442 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 TMEM8AQ9HCN3 771 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 UBN1Q9NPG3 1134 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 PRDM6Q9NQX0 595 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 MIOSQ9NXC5 875 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 KLK14Q9P0G3 267 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 SIX4Q9UIU6 781 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 SIK3Q9Y2K2 1263 aa8.47□□□□□ -1.05
C16orf62-211ENST00000540101 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
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