RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538351.6

ZNF438-208, Transcript of zinc finger protein 438, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF438, Length 3,284 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF438-208	ENST00000538351	TUBA4A	P68366	448 aa		8.34	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	KRT81	Q14533	505 aa		8.34	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	ARHGEF6	Q15052	776 aa		8.34	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		8.34	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	POTEH	Q6S545	545 aa		8.34	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		8.34	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	ZNF410	Q86VK4	478 aa		8.34	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		8.34	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		8.34	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		8.34	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		8.34	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	NPHS2	Q9NP85	383 aa		8.34	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	GIN1	Q9NXP7	522 aa		8.34	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	KLRF2	D3W0D1	207 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	MCF2L	O15068	1137 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	AP1G1	O43747	822 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	PHF2	O75151	1096 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	CHRNB1	P11230	501 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	KRT13	P13646	458 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	HSD17B4	P51659	736 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	NCOA4	Q13772	614 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	IL23R	Q5VWK5	629 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	PAOX	Q6QHF9	649 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	NLRP10	Q86W26	655 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	SPERT	Q8NA61	448 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	EME1	Q96AY2	570 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	VPS51	Q9UID3	782 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351		A0A088AWK7	358 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351		A0A1W2PRG0	241 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	FAM187A	A6NFU0	413 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	SFI1	A8K8P3	1242 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	C2CD2L	O14523	706 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	CCNE1	P24864	410 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	SERPINB6	P35237	376 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	CNGA3	Q16281	694 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	PHKG1	Q16816	387 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	ESX1	Q8N693	406 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	SNX25	Q9H3E2	840 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	SIAE	Q9HAT2	523 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		8.33	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	8.32	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	8.32	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	TSPY2	A6NKD2	308 aa		8.32	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	FOXP2	O15409	715 aa		8.32	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	TLR2	O60603	784 aa		8.32	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	TSPY3	P0CV98	308 aa		8.32	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	TSPY8	P0CW00	308 aa		8.32	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	ZNF12	P17014	697 aa		8.32	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	PRKACB	P22694	351 aa		8.32	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	8.32	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	TSPY1	Q01534	308 aa		8.32	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	PTGDR	Q13258	359 aa		8.32	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	8.32	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	PRKG1	Q13976	671 aa		8.32	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	8.32	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	8.32	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	KCNJ8	Q15842	424 aa		8.32	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	8.32	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		8.32	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		8.32	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	KAZN	Q674X7	775 aa		8.32	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		8.32	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		8.32	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		8.32	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		8.32	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	SPATA5	Q8NB90	893 aa		8.32	□□□□□ -1.08
ZNF438-208	ENST00000538351	PANX3	Q96QZ0	392 aa		8.32	□□□□□ -1.08

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms