RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534143.5

CMTM1-220, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CMTM1, Length 781 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-220ENST00000534143 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 SFR1Q86XK3 245 aa6.76□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.76□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 C1orf127Q8N9H9 656 aa6.76□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 KIAA0895Q8NCT3 520 aa6.76□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 SH3TC2Q8TF17 1288 aa6.76□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 HPS3Q969F9 1004 aa6.76□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 PMEPA1Q969W9 287 aa6.76□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 MED15Q96RN5 788 aa6.76□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 BPIFA3Q9BQP9 254 aa6.76□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 STRA6Q9BX79 667 aa6.76□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 PBX4Q9BYU1 374 aa6.76□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 MUC3BQ9H195 1237 aa6.76□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 DNAJC25Q9H1X3 360 aa6.76□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.76□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 SEMA6BQ9H3T3 888 aa6.76□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 SPC25Q9HBM1 224 aa6.76□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa6.76□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 OLFML3Q9NRN5 406 aa6.76□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 EXOC1Q9NV70 894 aa6.76□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 SEL1LQ9UBV2 794 aa6.76□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 GDAQ9Y2T3 454 aa6.76□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa6.76□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 COL1A2P08123 1366 aa6.76□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 DYNC1I1O14576 645 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 GAS2O43903 313 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 OFD1O75665 1012 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 C22orf31O95567 290 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 CAVIN2O95810 425 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 ABL1P00519 1130 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 MYL3P08590 195 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 PLS3P13797 630 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 CES1P23141 567 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 KLRC1P26715 233 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 HOXC8P31273 242 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 PPP1R2P41236 205 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 ZNF165P49910 485 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 RTP1P59025 263 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 ADAM17P78536 824 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 NCAPHQ15003 741 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 EMC2Q15006 297 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 SETDB1Q15047 1291 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 MARCH8Q5T0T0 291 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 MAEAQ7L5Y9 396 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 ZNF720Q7Z2F6 126 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 EXOC8Q8IYI6 725 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 ADSSL1Q8N142 457 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 LINC01465Q8N7H1 131 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 MCPH1Q8NEM0 835 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 KIFAP3Q92845 792 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 KCNN1Q92952 543 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 DRC1Q96MC2 740 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 C17orf75Q9HAS0 396 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 PARVGQ9HBI0 331 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 CBX8Q9HC52 389 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 SLC39A2Q9NP94 309 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 GPRC5CQ9NQ84 441 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 EGFL7Q9UHF1 273 aa6.75□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 RRN3P2A6NIE6 340 aa6.74□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 MAGEB2O15479 319 aa6.74□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 ZEB2O60315 1214 aa6.74□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 FZD6O60353 706 aa6.74□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 TBCAO75347 108 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa6.74□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa6.74□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 GLRA2P23416 452 aa6.74□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 CCNE1P24864 410 aa6.74□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 ITGB7P26010 798 aa6.74□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 HOXD13P35453 343 aa6.74□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 NPTX2P47972 431 aa6.74□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 CASP5P51878 434 aa6.74□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 NCKAP1LP55160 1127 aa6.74□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 PPFIA1Q13136 1202 aa6.74□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 DRP2Q13474 957 aa6.74□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 LRRC41Q15345 812 aa6.74□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 KCNA10Q16322 511 aa6.74□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.74□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 KIAA0753Q2KHM9 967 aa6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms