RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 IFNAR2P48551 515 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 CLK2P49760 499 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 DNM2P50570 870 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 CCT8P50990 548 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 GALK1P51570 392 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 QRICH1Q2TAL8 776 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 FIGNQ5HY92 759 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 ECHDC2Q86YB7 292 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 KBTBD2Q8IY47 623 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 PEX5LQ8IYB4 626 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 SCFD2Q8WU76 684 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 NOX5Q96PH1 765 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 KRT82Q9NSB4 513 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 PLAGL2Q9UPG8 496 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 ITM2BQ9Y287 266 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 C10orf71Q711Q0 1435 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 CCDC162PA2VCL2 907 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 TCP11X1B4DZS4 312 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 VDRP11473 427 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 CCNE1P24864 410 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 KIF11P52732 1056 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 SLC34A1Q06495 639 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 INAQ16352 499 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 KRT79Q5XKE5 535 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 SLFN13Q68D06 897 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 CNNM4Q6P4Q7 775 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 KCNK18Q7Z418 384 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 NELFCDQ8IXH7 590 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 NACC2Q96BF6 587 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 KANSL2Q9H9L4 492 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 NDUFA13Q9P0J0 144 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF711Q9Y462 761 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa9.01□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 BICDL2A1A5D9 508 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 CCDC169A6NNP5 214 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 EPHB2P29323 1055 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 GTF2H1P32780 548 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 PMS2P54278 862 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 SNAP25P60880 206 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 CCDC6Q16204 474 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 CCDC153Q494R4 210 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 ZCWPW2Q504Y3 356 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 CGB2Q6NT52 195 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 C4orf50Q6ZRC1 276 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 KLHL7Q8IXQ5 586 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 ZBED8Q8IZ13 594 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 HAS1Q92839 578 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 IDI2Q9BXS1 227 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 AIPL1Q9NZN9 384 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 KLHL14Q9P2G3 628 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 STK17AQ9UEE5 414 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 TBC1D12O60347 775 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 MEI1Q5TIA1 1274 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 KLHL35Q6PF15 583 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 Q6ZNX1 250 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 QPCTLQ9NXS2 382 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 RABL2BQ9UNT1 228 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 TTLL3Q9Y4R7 772 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 TBX10O75333 385 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 T-ENOLP0DO92 83 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 COL6A2P12110 1019 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 GRIA2P42262 883 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 KLK7P49862 253 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 ARFIP2P53365 341 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 IKQ13123 557 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 ECM1Q16610 540 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 STYK1Q6J9G0 422 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 TRIM67Q6ZTA4 783 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 RSPH3Q86UC2 560 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 SIAH1Q8IUQ4 282 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 NUP93Q8N1F7 819 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 SCAIQ8N9R8 606 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 PPFIBP2Q8ND30 876 aa9□□□□□ -0.97
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TRPS1-209ENST00000519674 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 MYLK2Q9H1R3 596 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-209ENST00000519674 SEMA6BQ9H3T3 888 aa9□□□□□ -0.97
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