RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM13AO94988 1023 aa16.55■□□□□ 0.24
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF131P52739 623 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GRIN1Q05586 938 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MCM6Q14566 821 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KARSQ15046 597 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PTPAQ15257 358 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANKS3Q6ZW76 656 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GLYCTKQ8IVS8 523 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FBXL6Q8N531 539 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MYCT1Q8N699 235 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ASIC4Q96FT7 647 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRKD2Q9BZL6 878 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PIDD1Q9HB75 910 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC39Q9UFE4 941 aa16.55■□□□□ 0.24
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 CLIC4Q9Y696 253 aa16.55■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRAK2O60296 914 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CLTAP09496 248 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP16.54■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HARSP12081 509 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RESTQ13127 1097 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RAB33AQ14088 237 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LIN9Q5TKA1 542 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CD300LGQ6UXG3 332 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RTL10Q7L3V2 364 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FEZF2Q8TBJ5 459 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BICD1Q96G01 975 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRRX2Q99811 253 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 STK17AQ9UEE5 414 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TBX20Q9UMR3 447 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BACE2Q9Y5Z0 518 aa16.54■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CLUHO75153 1309 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRIOO75962 3097 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PODXLO00592 558 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TBCAO75347 108 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MYBP10242 640 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HOXA9P31269 272 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TXLNAP40222 546 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP16.53■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LIG4P49917 911 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UVSSAQ2YD98 709 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC10A6Q3KNW5 377 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EPSTI1Q96J88 318 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TSPAN18Q96SJ8 248 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP16.53■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGSF9Q9P2J2 1179 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MTRRQ9UBK8 725 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FBXW11Q9UKB1 542 aa16.53■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 K7ENM7 598 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PIGRP01833 764 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ASGR2P07307 311 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OR1D2P34982 312 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C3orf58Q8NDZ4 430 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LRRC15Q8TF66 581 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NXPE3Q969Y0 559 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZHX3Q9H4I2 956 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EPS15L1Q9UBC2 864 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MTMR6Q9Y217 621 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NUB1Q9Y5A7 615 aa16.52■□□□□ 0.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SYN3O14994 580 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 STX6O43752 255 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 XYLBO75191 536 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TKTP29401 623 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BRCC3P46736 316 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GTF2BQ00403 316 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TDGQ13569 410 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC39A14Q15043 492 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPM1LQ5SGD2 360 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RRAGBQ5VZM2 374 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 USP49Q70CQ1 688 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SNX21Q969T3 373 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KCNK12Q9HB15 430 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A0A0B4J269 797 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TTC26A0AVF1 554 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 H7C4K7 107 aa16.5■□□□□ 0.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OGTO15294 1046 aa16.5■□□□□ 0.23
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