RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-215ENST00000506510 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.22□□□□□ -1.41
PDE4D-215ENST00000506510 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.22□□□□□ -1.41
PDE4D-215ENST00000506510 RHOT1Q8IXI2 618 aa6.22□□□□□ -1.41
PDE4D-215ENST00000506510 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa6.22□□□□□ -1.41
PDE4D-215ENST00000506510 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.22□□□□□ -1.41
PDE4D-215ENST00000506510 C7orf25Q9BPX7 421 aa6.22□□□□□ -1.41
PDE4D-215ENST00000506510 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.22□□□□□ -1.41
PDE4D-215ENST00000506510 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.22□□□□□ -1.41
PDE4D-215ENST00000506510 KLHL33A6NCF5 533 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 DIRC3C9JPN6 131 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 MTM1Q13496 603 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF529Q6P280 563 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 Q6ZPA2 131 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 DRC7Q8IY82 874 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 TEKT5Q96M29 485 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 MANSC1Q9H8J5 431 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 CHPF2Q9P2E5 772 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 NDUFA10O95299 355 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 SPATA31D3P0C874 917 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 KRT4P19013 534 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 TGFB2P61812 414 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 PTPN21Q16825 1174 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 LY6G5CQ5SRR4 150 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 AGAP9Q5VTM2 703 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 MIGA2Q7L4E1 593 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 CHFRQ96EP1 664 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 MYEOVQ96EZ4 313 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 FBXO34Q9NWN3 711 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 HS3ST4Q9Y661 456 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 TEX33O43247 280 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 PPFIA4O75335 1185 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 PEX14O75381 377 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 DDCP20711 480 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 SLC6A2P23975 617 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 SLC16A1P53985 500 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 INHBCP55103 352 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 ATP8B2P98198 1209 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 DPTQ07507 201 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 PLEKHG6Q3KR16 790 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 VRK3Q8IV63 474 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 ULK2Q8IYT8 1036 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 OR56A1Q8NGH5 318 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 MORC4Q8TE76 937 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 TTPALQ9BTX7 342 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 IKZF4Q9H2S9 585 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 TNKSO95271 1327 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 GAGE12BA1L429 117 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 UNC119BA6NIH7 251 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 POMCP01189 267 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 WASP42768 502 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 FSTL1Q12841 308 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 UBXN2BQ14CS0 331 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 PTPAQ15257 358 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 C3orf36Q3SXR2 165 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 TSHZ3Q63HK5 1081 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 MRGPRGQ86SM5 289 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 RHOT2Q8IXI1 618 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 TMX3Q96JJ7 454 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 ZSWIM1Q9BR11 485 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 TDP1Q9NUW8 608 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM200CA6NKL6 621 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 PRSS23O95084 383 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 KRT85P78386 507 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 IL10RAQ13651 578 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 ODF1Q14990 250 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 HDAC10Q969S8 669 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 PRRX2Q99811 253 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 SERPINB13Q9UIV8 391 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 IPPQ9Y573 584 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-215ENST00000506510 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa6.17□□□□□ -1.42
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