RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 GYPCP04921 128 aa6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 CDC25AP30304 524 aa6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 RGS2P41220 211 aa6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 PPP1R2P41236 205 aa6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 PSMC4P43686 418 aa6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 TUBB4BP68371 445 aa6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 SP3Q02447 781 aa6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 NEDD9Q14511 834 aa6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 TTLL4Q14679 1199 aa6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 TEX35Q5T0J7 233 aa6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 CYP26C1Q6V0L0 522 aa6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 SV2BQ7L1I2 683 aa6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 EEPD1Q7L9B9 569 aa6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 MIER3Q7Z3K6 550 aa6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 ADSSL1Q8N142 457 aa6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 CEP112Q8N8E3 955 aa6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 ASAP3Q8TDY4 903 aa6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 RABGGTAQ92696 567 aa6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 HAS1Q92839 578 aa6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 GATA6Q92908 595 aa6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC5A5Q92911 643 aa6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 THAP9Q9H5L6 903 aa6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 MLXIPQ9HAP2 919 aa6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 KCNMB3Q9NPA1 279 aa6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 LZTFL1Q9NQ48 299 aa6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 ABHD10Q9NUJ1 306 aa6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
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ARHGEF3-215ENST00000498517 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa6.12□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 FRMPD4Q14CM0 1322 aa6.11□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa6.11□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A1W2PQC6 194 aa6.11□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 BICDL2A1A5D9 508 aa6.11□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 CTAGE9A4FU28 777 aa6.11□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 CARNS1A5YM72 827 aa6.11□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 PP2D1A8MPX8 630 aa6.11□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 LGALS16A8MUM7 142 aa6.11□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
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ARHGEF3-215ENST00000498517 KLRC4O43908 158 aa6.11□□□□□ -1.43
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ARHGEF3-215ENST00000498517 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 TXNP10599 105 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
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ARHGEF3-215ENST00000498517 ITGB5P18084 799 aa6.11□□□□□ -1.43
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ARHGEF3-215ENST00000498517 SFNP31947 248 aa6.11□□□□□ -1.43
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ARHGEF3-215ENST00000498517 UBXN1Q04323 297 aa6.11□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 GRB14Q14449 540 aa6.11□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 EPHA7Q15375 998 aa6.11□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 TERF2Q15554 542 aa6.11□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF792Q3KQV3 632 aa6.11□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 NAALADL2Q58DX5 795 aa6.11□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF569Q5MCW4 686 aa6.11□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 CBLL1Q75N03 491 aa6.11□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM114A1Q8IWE2 563 aa6.11□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 TPH2Q8IWU9 490 aa6.11□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
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ARHGEF3-215ENST00000498517 SCFD2Q8WU76 684 aa6.11□□□□□ -1.43
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ARHGEF3-215ENST00000498517 GJA10Q969M2 543 aa6.11□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
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ARHGEF3-215ENST00000498517 TINF2Q9BSI4 451 aa6.11□□□□□ -1.43
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ARHGEF3-215ENST00000498517 VTA1Q9NP79 307 aa6.11□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 KBTBD4Q9NVX7 518 aa6.11□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 RNF186Q9NXI6 227 aa6.11□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 MYO1AQ9UBC5 1043 aa6.11□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 SLC9A2Q9UBY0 812 aa6.11□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 CDC23Q9UJX2 597 aa6.11□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 GDAQ9Y2T3 454 aa6.11□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa6.11□□□□□ -1.43
ARHGEF3-215ENST00000498517 FHOD1Q9Y613 1164 aa6.11□□□□□ -1.43
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