RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496015.5

ABCD4-217, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 5

Gene ABCD4, Length 1,248 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-217ENST00000496015 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 BACH2Q9BYV9 841 aa14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
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ABCD4-217ENST00000496015 TBCAO75347 108 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
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ABCD4-217ENST00000496015 ANKS3Q6ZW76 656 aa14.91□□□□□ -0.02
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ABCD4-217ENST00000496015 PARVGQ9HBI0 331 aa14.91□□□□□ -0.02
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ABCD4-217ENST00000496015 PAPLNO95428 1278 aa14.9□□□□□ -0.02
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ABCD4-217ENST00000496015 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 SYT1P21579 422 aa14.9□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 LIG4P49917 911 aa14.9□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 NCKAP1LP55160 1127 aa14.9□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 TDGQ13569 410 aa14.9□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 MCM6Q14566 821 aa14.9□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 KARSQ15046 597 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 PPM1LQ5SGD2 360 aa14.9□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 CCSER1Q9C0I3 900 aa14.9□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 ZHX3Q9H4I2 956 aa14.9□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa14.9□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa14.9□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 CNTN3Q9P232 1028 aa14.9□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 IGSF9Q9P2J2 1179 aa14.9□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 FBXW11Q9UKB1 542 aa14.9□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 NUB1Q9Y5A7 615 aa14.9□□□□□ -0.02
ABCD4-217ENST00000496015 K7ENM7 598 aa14.89□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 PODXLO00592 558 aa14.89□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 ABLIM1O14639 778 aa14.89□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
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ABCD4-217ENST00000496015 OR1D2P34982 312 aa14.89□□□□□ -0.03
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ABCD4-217ENST00000496015 RAB33AQ14088 237 aa14.89□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 RTL10Q7L3V2 364 aa14.89□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 KCNN1Q92952 543 aa14.89□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 NXPE3Q969Y0 559 aa14.89□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
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ABCD4-217ENST00000496015 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa14.89□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 MTRRQ9UBK8 725 aa14.89□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 TBX20Q9UMR3 447 aa14.89□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 BACE2Q9Y5Z0 518 aa14.89□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 CLIC4Q9Y696 253 aa14.89□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 DOCK8Q8NF50 2099 aa14.88□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 TRAK2O60296 914 aa14.88□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 C8AP07357 584 aa14.88□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 HOXA9P31269 272 aa14.88□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 ZNF131P52739 623 aa14.88□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 GRIN1Q05586 938 aa14.88□□□□□ -0.03
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ABCD4-217ENST00000496015 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
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ABCD4-217ENST00000496015 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 MFSD1Q9H3U5 465 aa14.88□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 KCNK12Q9HB15 430 aa14.88□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 EPS15L1Q9UBC2 864 aa14.88□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 STK17AQ9UEE5 414 aa14.88□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 CDY1Q9Y6F8 540 aa14.88□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 DOCK6Q96HP0 2047 aa14.87□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 KMT2EQ8IZD2 1858 aa14.87□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 H7C4K7 107 aa14.87□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 I3L4J1 428 aa14.87□□□□□ -0.03
ABCD4-217ENST00000496015 SYN3O14994 580 aa14.87□□□□□ -0.03
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