RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495113.5

TMBIM1-223, Transcript of transmembrane BAX inhibitor motif containing 1, human

TSL 2

Gene TMBIM1, Length 596 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMBIM1-223	ENST00000495113	TREH	O43280	583 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113	VNN1	O95497	513 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113	FAM228B	P0C875	321 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113	STAG3L1	P0CL83	205 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113	GRM5	P41594	1212 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113	WNT7B	P56706	349 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113	BPIFB4	P59827	614 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113	NCOA4	Q13772	614 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113	NOTUM	Q6P988	496 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113	RPAIN	Q86UA6	219 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113	RSPH3	Q86UC2	560 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113	TRIM58	Q8NG06	486 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113	TAF4B	Q92750	862 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113	NAGPA	Q9UK23	515 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TMBIM1-223	ENST00000495113		A0A0U1RQJ8	604 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	ANO9	A1A5B4	782 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	CTAGE9	A4FU28	777 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	LRRN2	O75325	713 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	TACC1	O75410	805 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	PGK1	P00558	417 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	TNFAIP3	P21580	790 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	CAP1	Q01518	475 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	TRIM32	Q13049	653 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	SNX17	Q15036	470 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	SEZ6	Q53EL9	994 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	RNF180	Q86T96	592 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	ZNF677	Q86XU0	584 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	SLC35F6	Q8N357	371 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	WDR24	Q96S15	920 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	OSMR	Q99650	979 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	AGPAT1	Q99943	283 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	DERA	Q9Y315	318 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	C2CD2	Q9Y426	696 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	RCCD1	A6NED2	376 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	13.07	□□□□□ -0.32	2e-7	■■□□□ 13.9
TMBIM1-223	ENST00000495113	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	CXCL8	P10145	99 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	ELN	P15502	786 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	ATIC	P31939	592 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	PDE6C	P51160	858 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	TRPC3	Q13507	836 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	CUL2	Q13617	745 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	HIC1	Q14526	733 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	H2AFV	Q71UI9	128 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	CEP120	Q8N960	986 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	TATDN2	Q93075	761 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	FAM212A	Q96EL1	285 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	CPB2	Q96IY4	423 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TMBIM1-223	ENST00000495113	ACAP3	Q96P50	834 aa		13.07	□□□□□ -0.32

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