RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490730.1

SYNE4-205, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 1,175 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-205ENST00000490730 TIPINQ9BVW5 301 aa22.99■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 PTPRHQ9HD43 1115 aa22.99■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22.99■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.99■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 CACNA1HO95180 2353 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 CITO14578 2027 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 STK25O00506 426 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 TRAPPC3O43617 180 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 PAPLNO95428 1278 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 MCF2P10911 925 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 LAMP2P13473 410 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 FGFR3P22607 806 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 GUCY2CP25092 1073 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 TKTP29401 623 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 BRCC3P46736 316 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 CLCN5P51795 746 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 NTHL1P78549 312 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 MPZL3Q6UWV2 235 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 C3orf58Q8NDZ4 430 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 SLC7A14Q8TBB6 771 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 ACAP3Q96P50 834 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 C17orf75Q9HAS0 396 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 SLC38A7Q9NVC3 462 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 CDY1Q9Y6F8 540 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 DOCK6Q96HP0 2047 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 XYLBO75191 536 aa22.97■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 SMTNP53814 917 aa22.97■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 SLC44A3Q8N4M1 653 aa22.97■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 SNX27Q96L92 541 aa22.97■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 MTRRQ9UBK8 725 aa22.97■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 PODXLO00592 558 aa22.96■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 PLA2G4BP0C869 781 aa22.96■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 PLS3P13797 630 aa22.96■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 RAB33AQ14088 237 aa22.96■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 HYIQ5T013 277 aa22.96■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 CA14Q9ULX7 337 aa22.96■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 USP34Q70CQ2 3546 aa22.96■■□□□ 1.27
SYNE4-205ENST00000490730 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.95■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 NPR3P17342 541 aa22.95■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 PROZP22891 400 aa22.95■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 MCM2P49736 904 aa22.95■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 SEZ6Q53EL9 994 aa22.95■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 CD300LGQ6UXG3 332 aa22.95■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 ALKAL1Q6UXT8 129 aa22.95■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 ANKS3Q6ZW76 656 aa22.95■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 SPIRE2Q8WWL2 714 aa22.95■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 NXPE3Q969Y0 559 aa22.95■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 NUMBLQ9Y6R0 609 aa22.95■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 ABLIM1O14639 778 aa22.94■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 PI15O43692 258 aa22.94■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 SRFP11831 508 aa22.94■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 AOC1P19801 751 aa22.94■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 HOXA9P31269 272 aa22.94■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 SLC12A3P55017 1021 aa22.94■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 HTR4Q13639 388 aa22.94■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 XKR4Q5GH76 650 aa22.94■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa22.94■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 BICD1Q96G01 975 aa22.94■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 WNT16Q9UBV4 365 aa22.94■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 KCNG1Q9UIX4 513 aa22.94■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.94■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 TOM1L1O75674 476 aa22.93■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 MAPTP10636 758 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 KCNE1P15382 129 aa22.93■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 ARPP19P56211 112 aa22.93■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.93■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.93■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa22.93■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 KCND2Q9NZV8 630 aa22.93■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 CNTN3Q9P232 1028 aa22.93■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 CDH7Q9ULB5 785 aa22.93■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 BACE2Q9Y5Z0 518 aa22.93■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 KRBA1A5PL33 1030 aa22.92■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 ANHXE9PGG2 379 aa22.92■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 GFRA3O60609 400 aa22.92■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 UVSSAQ2YD98 709 aa22.92■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SYNE4-205ENST00000490730 KCTD17Q8N5Z5 321 aa22.92■■□□□ 1.26
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