RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 ZMYND10O75800 440 aa30.47■■■□□ 2.47
HOXB3-211ENST00000490677 B3GAT3O94766 335 aa30.47■■■□□ 2.47
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HOXB3-211ENST00000490677 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
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HOXB3-211ENST00000490677 USP49Q70CQ1 688 aa30.41■■■□□ 2.46
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM130Q8N3G9 435 aa30.41■■■□□ 2.46
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HOXB3-211ENST00000490677 HOXA9P31269 272 aa30.4■■■□□ 2.46
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HOXB3-211ENST00000490677 TTC26A0AVF1 554 aa30.37■■■□□ 2.45
HOXB3-211ENST00000490677 TRAPPC3O43617 180 aa30.37■■■□□ 2.45
HOXB3-211ENST00000490677 POU2F2P09086 479 aa30.37■■■□□ 2.45
HOXB3-211ENST00000490677 CXCL8P10145 99 aa30.37■■■□□ 2.45
HOXB3-211ENST00000490677 LAMP2P13473 410 aa30.37■■■□□ 2.45
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