RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487539.1

CNN3-206, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 739 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-206ENST00000487539 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa5.51□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 NUB1Q9Y5A7 615 aa5.51□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa5.51□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 NCOR2Q9Y618 2525 aa5.51□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 CACNA1HO95180 2353 aa5.51□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 MYO15AQ9UKN7 3530 aa5.51□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 FAM186AA6NE01 2351 aa5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 DMDP11532 3685 aa5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 DNM1LO00429 736 aa5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 KIAA0355O15063 1070 aa5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 NOBOXO60393 691 aa5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 MSCO60682 206 aa5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 FAM153BP0C7A2 387 aa5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 GRK2P25098 689 aa5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 CNGA1P29973 690 aa5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 GRK3P35626 688 aa5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 GYG1P46976 350 aa5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 KCNJ4P48050 445 aa5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 GABREP78334 506 aa5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 SPIRE1Q08AE8 756 aa5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 KLF10Q13118 480 aa5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 FAM209AQ5JX71 171 aa5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 ZNF365Q70YC5 407 aa5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 FAM126BQ8IXS8 530 aa5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 HERVK_113Q902F9 699 aa5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 LPAR1Q92633 364 aa5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 ZNF747Q9BV97 191 aa5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 LNPKQ9C0E8 428 aa5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 PORCNQ9H237 461 aa5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 CDIP1Q9H305 208 aa5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 BCAS3Q9H6U6 928 aa5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 SLC6A20Q9NP91 592 aa5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 TECTAO75443 2155 aa5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 COL4A6Q14031 1691 aa5.5□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 BLACEA4D250 179 aa5.49□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa5.49□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 PLIN1O60240 522 aa5.49□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 TADA3O75528 432 aa5.49□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 SOD2P04179 222 aa5.49□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 CLTBP09497 229 aa5.49□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 IL9P15248 144 aa5.49□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 CYP2C19P33261 490 aa5.49□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 MC3RP41968 323 aa5.49□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 KCTD2Q14681 263 aa5.49□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 ASCL5Q7RTU5 278 aa5.49□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 FAM83AQ86UY5 434 aa5.49□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 ZNF575Q86XF7 245 aa5.49□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 TRIM48Q8IWZ4 208 aa5.49□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa5.49□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 FNIP1Q8TF40 1166 aa5.49□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa5.49□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 EXOC2Q96KP1 924 aa5.49□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 ANKRD2Q9GZV1 360 aa5.49□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 KCNH6Q9H252 994 aa5.49□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 VPS11Q9H270 941 aa5.49□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 SMOC1Q9H4F8 434 aa5.49□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 MYOTQ9UBF9 498 aa5.49□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 PLXNA3P51805 1871 aa5.49□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa5.49□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 A0A0G2JMZ2 1700 aa5.48□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 SMCHD1A6NHR9 2005 aa5.48□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 ATRNL1Q5VV63 1379 aa5.48□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 EFCAB14O75071 495 aa5.48□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 IGKV5-2P06315 115 aa5.48□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 GNAT1P11488 350 aa5.48□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 CSF2RAP15509 400 aa5.48□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 NKX3-2P78367 333 aa5.48□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 C2orf27AQ580R0 203 aa5.48□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa5.48□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 FOXB2Q5VYV0 432 aa5.48□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 OTOP3Q7RTS5 596 aa5.48□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 ZNF804AQ7Z570 1209 aa5.48□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 SCYL3Q8IZE3 742 aa5.48□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 CCDC191Q8NCU4 936 aa5.48□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 FAM151AQ8WW52 585 aa5.48□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 PLEKHF1Q96S99 279 aa5.48□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 JAM3Q9BX67 310 aa5.48□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 SLC28A3Q9HAS3 691 aa5.48□□□□□ -1.53
CNN3-206ENST00000487539 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms