RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 NELFAQ9H3P2 528 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 PLA2G3Q9NZ20 509 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 CD2APQ9Y5K6 639 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 RNF123Q5XPI4 1314 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 KIF16BQ96L93 1317 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 ADCY9O60503 1353 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1W2PRX2 142 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 KPNA6O60684 536 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 GAS7O60861 476 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 FZD7O75084 574 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 RPS6KA4O75676 772 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 DDX58O95786 925 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 STAT3P40763 770 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 NEK4P51957 841 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 HGFACQ04756 655 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 RIN1Q13671 783 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 GRM7Q14831 915 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 EPHA7Q15375 998 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 KIF6Q6ZMV9 814 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 ITPRIPQ8IWB1 547 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 GPR135Q8IZ08 494 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 DNAAF4Q8WXU2 420 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 APPBP2Q92624 585 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 CHMP4AQ9BY43 222 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 CSRNP2Q9H175 543 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 TLR9Q9NR96 1032 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 TOMM22Q9NS69 142 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 PTPRCP08575 1304 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 C4BP0C0L5 1744 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 CACNA1FO60840 1977 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 COL15A1P39059 1388 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 CAPN14A8MX76 684 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 CAMTA2O94983 1202 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 APOL3O95236 402 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 IGKV5-2P06315 115 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 RFC4P35249 363 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 BEND3Q5T5X7 828 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 Q6ZSN1 163 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 SGMS1Q86VZ5 419 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 Q8N1X5 172 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 D2HGDHQ8N465 521 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 PLBD2Q8NHP8 589 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 ARHGAP45Q92619 1136 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 DYDC2Q96IM9 177 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 C16orf92Q96LL3 132 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 OXSMQ9NWU1 459 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 STK32BQ9NY57 414 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 KCMF1Q9P0J7 381 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 ABCC4O15439 1325 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 GOLGA8BA8MQT2 603 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 ACRV1P26436 265 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 BCAR1P56945 870 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 BPIFB4P59827 614 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 ADCY1Q08828 1119 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 TCIRG1Q13488 830 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 MVPQ14764 893 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 MYBPC3Q14896 1274 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 SLC15A2Q16348 729 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 CNNM4Q6P4Q7 775 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 C1orf210Q8IVY1 113 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 ZFPM1Q8IX07 1006 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 SYNE4Q8N205 404 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 RABGGTAQ92696 567 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 EXTL1Q92935 676 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 MEIS3Q99687 375 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 SLC6A15Q9H2J7 730 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 FANCLQ9NW38 375 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 NARFQ9UHQ1 456 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 DNAI1Q9UI46 699 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 SPO11Q9Y5K1 396 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF831Q5JPB2 1677 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 UBR3Q6ZT12 1888 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 NUP98P52948 1817 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRC-211ENST00000484135 TLDC2A0PJX2 215 aa5.84□□□□□ -1.47
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