RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482056.2

C9orf3-218, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf3, Length 1,951 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-218ENST00000482056 GABBR1Q9UBS5 961 aa16.41■□□□□ 0.22
C9orf3-218ENST00000482056 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa16.41■□□□□ 0.22
C9orf3-218ENST00000482056 PSAPP07602 524 aa16.4■□□□□ 0.22
C9orf3-218ENST00000482056 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
C9orf3-218ENST00000482056 TNFAIP1Q13829 316 aa16.4■□□□□ 0.22
C9orf3-218ENST00000482056 LIN9Q5TKA1 542 aa16.4■□□□□ 0.22
C9orf3-218ENST00000482056 KCNV1Q6PIU1 500 aa16.4■□□□□ 0.22
C9orf3-218ENST00000482056 MCOLN2Q8IZK6 566 aa16.4■□□□□ 0.22
C9orf3-218ENST00000482056 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
C9orf3-218ENST00000482056 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
C9orf3-218ENST00000482056 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
C9orf3-218ENST00000482056 ARID2Q68CP9 1835 aa16.4■□□□□ 0.22
C9orf3-218ENST00000482056 GRIN3BO60391 1043 aa16.4■□□□□ 0.22
C9orf3-218ENST00000482056 NSFP46459 744 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
C9orf3-218ENST00000482056 CENPCQ03188 943 aa16.4■□□□□ 0.22
C9orf3-218ENST00000482056 AUHQ13825 339 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
C9orf3-218ENST00000482056 PTK6Q13882 451 aa16.4■□□□□ 0.22
C9orf3-218ENST00000482056 ITIH4Q14624 930 aa16.4■□□□□ 0.22
C9orf3-218ENST00000482056 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
C9orf3-218ENST00000482056 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa16.4■□□□□ 0.22
C9orf3-218ENST00000482056 SLC39A4Q6P5W5 647 aa16.4■□□□□ 0.22
C9orf3-218ENST00000482056 CPNE8Q86YQ8 564 aa16.4■□□□□ 0.22
C9orf3-218ENST00000482056 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
C9orf3-218ENST00000482056 C1orf54Q8WWF1 131 aa16.4■□□□□ 0.22
C9orf3-218ENST00000482056 BSNDQ8WZ55 320 aa16.4■□□□□ 0.22
C9orf3-218ENST00000482056 SERPINB12Q96P63 405 aa16.4■□□□□ 0.22
C9orf3-218ENST00000482056 FNBP1Q96RU3 617 aa16.4■□□□□ 0.22
C9orf3-218ENST00000482056 FAM213AQ9BRX8 229 aa16.4■□□□□ 0.22
C9orf3-218ENST00000482056 CCDC113Q9H0I3 377 aa16.4■□□□□ 0.22
C9orf3-218ENST00000482056 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa16.4■□□□□ 0.22
C9orf3-218ENST00000482056 WDR81Q562E7 1941 aa16.39■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 WNT10BO00744 389 aa16.39■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 EXTL3O43909 919 aa16.39■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 UNGP13051 313 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 ATF2P15336 505 aa16.39■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 SLCO1A2P46721 670 aa16.39■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 NBPF9Q3BBW0 867 aa16.39■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa16.39■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 TRIM72Q6ZMU5 477 aa16.39■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 BBOF1Q8ND07 529 aa16.39■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 CDHR1Q96JP9 859 aa16.39■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 OSBPL7Q9BZF2 842 aa16.39■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 ADAM7Q9H2U9 754 aa16.39■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 KLC4Q9NSK0 619 aa16.39■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 RNF146Q9NTX7 359 aa16.39■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 LIG4P49917 911 aa16.38■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 PTP4A2Q12974 167 aa16.38■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 SNX1Q13596 522 aa16.38■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP16.38■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 VSIG10LQ86VR7 867 aa16.38■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 CCDC50Q8IVM0 306 aa16.38■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 SLC40A1Q9NP59 571 aa16.38■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 MYOZ2Q9NPC6 264 aa16.38■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 STK32BQ9NY57 414 aa16.38■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 NR3C2P08235 984 aa16.38■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 VIMP08670 466 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 STRN3Q13033 797 aa16.38■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 CEP128Q6ZU80 1094 aa16.38■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 ATL2Q8NHH9 583 aa16.38■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 DYDC1Q8WWB3 177 aa16.38■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 CCT6BQ92526 530 aa16.38■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 PI4K2AQ9BTU6 479 aa16.38■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 MROH7Q68CQ1 1323 aa16.38■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 CCT8L1PA6NM43 557 aa16.37■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 VWA5AO00534 786 aa16.37■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 PSTPIP1O43586 416 aa16.37■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 RASSF9O75901 435 aa16.37■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 TNNI1P19237 187 aa16.37■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 CETN2P41208 172 aa16.37■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 PIK3CAP42336 1068 aa16.37■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 SCTRP47872 440 aa16.37■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 MTMR2Q13614 643 aa16.37■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 PSMD6Q15008 389 aa16.37■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa16.37■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 PIGWQ7Z7B1 504 aa16.37■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 SCLT1Q96NL6 688 aa16.37■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 TRAIPQ9BWF2 469 aa16.37■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 DCLK3Q9C098 648 aa16.37■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 ANAPC5Q9UJX4 755 aa16.37■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 NFASCO94856 1347 aa16.37■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 COL4A5P29400 1685 aa16.37■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 PROSCO94903 275 aa16.37■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 RRM1P23921 792 aa16.37■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 CNGA2Q16280 664 aa16.37■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 SWSAP1Q6NVH7 229 aa16.37■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 RHBDF2Q6PJF5 856 aa16.37■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 RHOT1Q8IXI2 618 aa16.37■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 LRRC34Q8IZ02 419 aa16.37■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 CPA5Q8WXQ8 436 aa16.37■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
C9orf3-218ENST00000482056 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms