RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 GCNT3O95395 438 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 LDHAP00338 332 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 ADH1AP07327 375 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 SLFN14P0C7P3 912 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 PAX3P23760 479 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 OSTNP61366 133 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 DSG1Q02413 1049 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 PPP2R3AQ06190 1150 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 CEP120Q8N960 986 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 MSLNLQ96KJ4 702 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 MSTO1Q9BUK6 570 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 FNIP2Q9P278 1114 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 A0A1W2PQ27 194 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 A0A1W2PQ64 194 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 A0A1W2PQD8 194 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 H3BQ06 376 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 TBX10O75333 385 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 B3GAT3O94766 335 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 ADRB2P07550 413 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 HARSP12081 509 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 IL9P15248 144 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 CYP3A5P20815 502 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 PLA2G5P39877 138 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 ASIC1P78348 528 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 ITIH3Q06033 890 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 UPP1Q16831 310 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 KIAA0319Q5VV43 1072 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 SYCP3Q8IZU3 236 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 SMRP1Q8NCR6 262 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 HDAC7Q8WUI4 952 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 FAM122AQ96E09 287 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 ASB7Q9H672 318 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 RXFP1Q9HBX9 757 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 CLEC1BQ9P126 229 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 DERAQ9Y315 318 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 UBE4BO95155 1302 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 TTC26A0AVF1 554 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 CASTOR2A6NHX0 329 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 LINC01565O15544 149 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 MBTPS2O43462 519 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 LILRB3O75022 631 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 GLP2RO95838 553 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 GARTP22102 1010 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 KLRC2P26717 231 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 SLC10A6Q3KNW5 377 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 CES5AQ6NT32 575 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 ANKRD54Q6NXT1 300 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 UNC13DQ70J99 1090 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 NT5DC4Q86YG4 428 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 POMGNT1Q8WZA1 660 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 KLHL5Q96PQ7 755 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 TTPALQ9BTX7 342 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 VN1R3Q9BXE9 311 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 C11orf16Q9NQ32 467 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa14.53□□□□□ -0.08
PRAME-211ENST00000476336 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-211ENST00000476336 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-211ENST00000476336 KIF4AO95239 1232 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-211ENST00000476336 CNPP09543 421 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PRAME-211ENST00000476336 ALADP13716 330 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-211ENST00000476336 SYKP43405 635 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-211ENST00000476336 CLCNKBP51801 687 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-211ENST00000476336 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PRAME-211ENST00000476336 PSMD2Q13200 908 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-211ENST00000476336 GLRA4Q5JXX5 417 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-211ENST00000476336 KANK3Q6NY19 840 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-211ENST00000476336 CYP26C1Q6V0L0 522 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-211ENST00000476336 PIK3R5Q8WYR1 880 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-211ENST00000476336 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PRAME-211ENST00000476336 NECTIN4Q96NY8 510 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-211ENST00000476336 GPR62Q9BZJ7 368 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-211ENST00000476336 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-211ENST00000476336 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PRAME-211ENST00000476336 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PRAME-211ENST00000476336 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PRAME-211ENST00000476336 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
PRAME-211ENST00000476336 HPSEQ9Y251 543 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-211ENST00000476336 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa14.52□□□□□ -0.09
PRAME-211ENST00000476336 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PRAME-211ENST00000476336 ARHGEF37A1IGU5 675 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-211ENST00000476336 PODXLO00592 558 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-211ENST00000476336 SYN3O14994 580 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-211ENST00000476336 FAM189A1O60320 539 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-211ENST00000476336 IL18RAPO95256 599 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAME-211ENST00000476336 CXCL8P10145 99 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms