RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475593.5

TFRC-211, Transcript of transferrin receptor, humanhuman

TSL 3

Gene TFRC, Length 875 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFRC-211ENST00000475593 RTP2Q5QGT7 225 aa6.64□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 FUT10Q6P4F1 479 aa6.64□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 PKN3Q6P5Z2 889 aa6.64□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 RETREG3Q86VR2 466 aa6.64□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 RHPN2Q8IUC4 686 aa6.64□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 HOMEZQ8IX15 550 aa6.64□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 CCDC82Q8N4S0 544 aa6.64□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 IRF7Q92985 503 aa6.64□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 RILPL2Q969X0 211 aa6.64□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 ELSPBP1Q96BH3 223 aa6.64□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 TCEAL4Q96EI5 215 aa6.64□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 GAD1Q99259 594 aa6.64□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 CLSTN3Q9BQT9 956 aa6.64□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 IER2Q9BTL4 223 aa6.64□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 COLEC11Q9BWP8 271 aa6.64□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 KRT23Q9C075 422 aa6.64□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 ZFP14Q9HCL3 533 aa6.64□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 CHST7Q9NS84 486 aa6.64□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.64□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 FBXW11Q9UKB1 542 aa6.64□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa6.64□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 ZMYM6O95789 1325 aa6.64□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 MYO16Q9Y6X6 1858 aa6.64□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 CACNA1EQ15878 2313 aa6.64□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 TMEM150BA6NC51 233 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 ZNF263O14978 683 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 ZNF623O75123 536 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 C1QL1O75973 258 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 PAPLNO95428 1278 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 CAPNS1P04632 268 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 RHOP08100 348 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 ITGA4P13612 1032 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 GJA1P17302 382 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 FCARP24071 287 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 GBP1P32455 592 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 MLH1P40692 756 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 MAPK8P45983 427 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 RAB27AP51159 221 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 SCNN1GP51170 649 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 FAM193AP78312 1265 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 IRX4P78413 519 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 LRRC32Q14392 662 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 PLK5Q496M5 336 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 VITQ6UXI7 678 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 PLA2G4DQ86XP0 818 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 LINC01465Q8N7H1 131 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 PNPLA1Q8N8W4 532 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 ZFP42Q96MM3 310 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 NLRP4Q96MN2 994 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 CORO1BQ9BR76 489 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 SLC6A16Q9GZN6 736 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 LY9Q9HBG7 655 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 FNIP2Q9P278 1114 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 CEP131Q9UPN4 1083 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 HES2Q9Y543 173 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 RAI2Q9Y5P3 530 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 TENM4Q6N022 2769 aa6.63□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 ACACAQ13085 2346 aa6.62□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa6.62□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 ARL5CA6NH57 179 aa6.62□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 DHX15O43143 795 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 PLEKHA8P1O95397 391 aa6.62□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 EFEMP2O95967 443 aa6.62□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 PSAPP07602 524 aa6.62□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 PSMC3P17980 439 aa6.62□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 OR1D2P34982 312 aa6.62□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 PSMD5Q16401 504 aa6.62□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 MTERF2Q49AM1 385 aa6.62□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 CEP55Q53EZ4 464 aa6.62□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 FAM171A1Q5VUB5 890 aa6.62□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.62□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 YAF2Q8IY57 180 aa6.62□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 FAM200AQ8TCP9 573 aa6.62□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 ZFYVE19Q96K21 471 aa6.62□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 MBOAT7Q96N66 472 aa6.62□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 HHIPQ96QV1 700 aa6.62□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 PAAF1Q9BRP4 392 aa6.62□□□□□ -1.35
TFRC-211ENST00000475593 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
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