RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469521.5

TRAPPC10-208, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC10, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAPPC10-208ENST00000469521 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
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TRAPPC10-208ENST00000469521 KYAT1Q16773 422 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 SV2BQ7L1I2 683 aa20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
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TRAPPC10-208ENST00000469521 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC10-208ENST00000469521 A0A087X0B3 334 aa20.58■□□□□ 0.89
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TRAPPC10-208ENST00000469521 HVCN1Q96D96 273 aa20.58■□□□□ 0.89
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TRAPPC10-208ENST00000469521 TRAPPC3O43617 180 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM189A1O60320 539 aa20.57■□□□□ 0.88
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TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC10A6Q3KNW5 377 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC10-208ENST00000469521 SEZ6Q53EL9 994 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC10-208ENST00000469521 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC10-208ENST00000469521 DYMQ7RTS9 669 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC10-208ENST00000469521 SFR1Q86XK3 245 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC10-208ENST00000469521 C3orf58Q8NDZ4 430 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC10-208ENST00000469521 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC10-208ENST00000469521 DNAJC19Q96DA6 116 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC10-208ENST00000469521 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa20.57■□□□□ 0.88
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TRAPPC10-208ENST00000469521 PPP1R37O75864 691 aa20.56■□□□□ 0.88
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TRAPPC10-208ENST00000469521 RPL9P32969 192 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
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TRAPPC10-208ENST00000469521 CD300LGQ6UXG3 332 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC10-208ENST00000469521 CYP26C1Q6V0L0 522 aa20.56■□□□□ 0.88
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TRAPPC10-208ENST00000469521 KCNG4Q8TDN1 519 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC10-208ENST00000469521 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
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TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC39A4Q6P5W5 647 aa20.55■□□□□ 0.88
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TRAPPC10-208ENST00000469521 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
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TRAPPC10-208ENST00000469521 USTQ9Y2C2 406 aa20.55■□□□□ 0.88
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TRAPPC10-208ENST00000469521 SP100P23497 879 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC10-208ENST00000469521 TNFSF9P41273 254 aa20.54■□□□□ 0.88
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TRAPPC10-208ENST00000469521 PDILTQ8N807 584 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC10-208ENST00000469521 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC10-208ENST00000469521 CLSTN3Q9BQT9 956 aa20.54■□□□□ 0.88
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TRAPPC10-208ENST00000469521 TNMDQ9H2S6 317 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC10-208ENST00000469521 CUEDC2Q9H467 287 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC10-208ENST00000469521 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC10-208ENST00000469521 MTRRQ9UBK8 725 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC10-208ENST00000469521 FBXW11Q9UKB1 542 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC10-208ENST00000469521 C2CD4DB7Z1M9 353 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC10-208ENST00000469521 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC10-208ENST00000469521 TKTP29401 623 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
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