RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 PLCB1Q9NQ66 1216 aa26.22■■□□□ 1.79
NME4-209ENST00000460297 PARP2Q9UGN5 583 aa26.22■■□□□ 1.79
NME4-209ENST00000460297 A0A0U1RQF3 1178 aa26.21■■□□□ 1.79
NME4-209ENST00000460297 MEIS3P2A8K0S8 358 aa26.21■■□□□ 1.79
NME4-209ENST00000460297 ZNF623O75123 536 aa26.21■■□□□ 1.79
NME4-209ENST00000460297 VNN1O95497 513 aa26.21■■□□□ 1.79
NME4-209ENST00000460297 AP3M2P53677 418 aa26.21■■□□□ 1.79
NME4-209ENST00000460297 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
NME4-209ENST00000460297 TRIM14Q14142 442 aa26.21■■□□□ 1.79
NME4-209ENST00000460297 DUOXA2Q1HG44 320 aa26.21■■□□□ 1.79
NME4-209ENST00000460297 SCARA3Q6AZY7 606 aa26.21■■□□□ 1.79
NME4-209ENST00000460297 CD302Q8IX05 232 aa26.21■■□□□ 1.79
NME4-209ENST00000460297 DBF4BQ8NFT6 615 aa26.21■■□□□ 1.79
NME4-209ENST00000460297 NEK11Q8NG66 645 aa26.21■■□□□ 1.79
NME4-209ENST00000460297 GANQ9H2C0 597 aa26.21■■□□□ 1.79
NME4-209ENST00000460297 RAB27AP51159 221 aa26.2■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 RGS18Q9NS28 235 aa26.2■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 KLK14Q9P0G3 267 aa26.2■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 CNTN3Q9P232 1028 aa26.2■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 PARNO95453 639 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 CXCL10P02778 98 aa26.19■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 ADKP55263 362 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 BIRC3Q13489 604 aa26.19■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 TCTN1Q2MV58 587 aa26.19■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 XKR4Q5GH76 650 aa26.19■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa26.19■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa26.19■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 TC2NQ8N9U0 490 aa26.19■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 LPPQ93052 612 aa26.19■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 RAB20Q9NX57 234 aa26.19■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 CAPN11Q9UMQ6 739 aa26.19■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 C2CD2Q9Y426 696 aa26.19■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 TRIM43BA6NCK2 446 aa26.19■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 HLA-DRAP01903 254 aa26.19■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 TMEM191BP0C7N4 346 aa26.19■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 ITGB8P26012 769 aa26.19■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 GSDMDP57764 484 aa26.19■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 TMEM132DQ14C87 1099 aa26.19■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 TMEM130Q8N3G9 435 aa26.19■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 FTHL17Q9BXU8 183 aa26.19■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 RNF19AQ9NV58 838 aa26.19■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 A0A1W2PQJ5 194 aa26.18■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 ITGA4P13612 1032 aa26.18■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 AGMOQ6ZNB7 445 aa26.18■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 KIF12Q96FN5 646 aa26.18■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa26.18■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 C9IYK1 514 aa26.17■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 KIAA0355O15063 1070 aa26.17■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 MFAP3LO75121 409 aa26.17■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 CST3P01034 146 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 UCHL3P15374 230 aa26.17■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 ZBTB6Q15916 424 aa26.17■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 GLRA4Q5JXX5 417 aa26.17■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa26.17■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 GJB7Q6PEY0 223 aa26.17■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 ECHDC2Q86YB7 292 aa26.17■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 HACE1Q8IYU2 909 aa26.17■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 SEPT8Q92599 483 aa26.17■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 ELMO3Q96BJ8 720 aa26.17■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 IQCDQ96DY2 449 aa26.17■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP26.17■■□□□ 1.783e-9■■■■■ 101.7
NME4-209ENST00000460297 CEP72Q9P209 647 aa26.17■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 DERAQ9Y315 318 aa26.17■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 TNNC2P02585 160 aa26.16■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 PIK3CAP42336 1068 aa26.16■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 SLC24A5Q71RS6 500 aa26.16■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 NT5DC4Q86YG4 428 aa26.16■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 C1orf127Q8N9H9 656 aa26.16■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 VWCEQ96DN2 955 aa26.16■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 ZFP42Q96MM3 310 aa26.16■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 PI4K2AQ9BTU6 479 aa26.16■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 NLRC4Q9NPP4 1024 aa26.16■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 APEX2Q9UBZ4 518 aa26.16■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 FHOD1Q9Y613 1164 aa26.16■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa26.15■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 PHACTR2O75167 634 aa26.15■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 TIMP1P01033 207 aa26.15■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 TPM1P09493 284 aa26.15■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 KCNE1P15382 129 aa26.15■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 KRT9P35527 623 aa26.15■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 LRMPQ12912 555 aa26.15■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 NCOA4Q13772 614 aa26.15■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 DEFB128Q7Z7B8 93 aa26.15■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 CXorf38Q8TB03 319 aa26.15■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 BAP1Q92560 729 aa26.15■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 APBB2Q92870 758 aa26.15■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 EDEM3Q9BZQ6 932 aa26.15■■□□□ 1.78
NME4-209ENST00000460297 SIX4Q9UIU6 781 aa26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms