RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456038.5

POLD2-208, Transcript of DNA polymerase delta 2, accessory subunit, human

TSL 3

Gene POLD2, Length 665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLD2-208	ENST00000456038	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
POLD2-208	ENST00000456038	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
POLD2-208	ENST00000456038	TDGF1	P13385	188 aa		11.21	□□□□□ -0.61
POLD2-208	ENST00000456038	CD72	P21854	359 aa		11.21	□□□□□ -0.61
POLD2-208	ENST00000456038	UBA7	P41226	1012 aa		11.21	□□□□□ -0.61
POLD2-208	ENST00000456038	CCR3	P51677	355 aa		11.21	□□□□□ -0.61
POLD2-208	ENST00000456038	POU5F1B	Q06416	359 aa		11.21	□□□□□ -0.61
POLD2-208	ENST00000456038	ADCY1	Q08828	1119 aa		11.21	□□□□□ -0.61
POLD2-208	ENST00000456038	IL17A	Q16552	155 aa		11.21	□□□□□ -0.61
POLD2-208	ENST00000456038	HYI	Q5T013	277 aa		11.21	□□□□□ -0.61
POLD2-208	ENST00000456038	ATL3	Q6DD88	541 aa		11.21	□□□□□ -0.61
POLD2-208	ENST00000456038	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		11.21	□□□□□ -0.61
POLD2-208	ENST00000456038	MTSS1L	Q765P7	747 aa		11.21	□□□□□ -0.61
POLD2-208	ENST00000456038	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		11.21	□□□□□ -0.61
POLD2-208	ENST00000456038	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
POLD2-208	ENST00000456038	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		11.21	□□□□□ -0.61
POLD2-208	ENST00000456038	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		11.21	□□□□□ -0.61
POLD2-208	ENST00000456038	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
POLD2-208	ENST00000456038	CHST12	Q9NRB3	414 aa		11.21	□□□□□ -0.61
POLD2-208	ENST00000456038	DACT1	Q9NYF0	836 aa		11.21	□□□□□ -0.61
POLD2-208	ENST00000456038	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
POLD2-208	ENST00000456038	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		11.21	□□□□□ -0.61
POLD2-208	ENST00000456038	ZBTB39	O15060	712 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	ZNF623	O75123	536 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	PAPLN	O95428	1278 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	ADH1A	P07327	375 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	UBXN11	Q5T124	520 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	PADI6	Q6TGC4	694 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	KSR1	Q8IVT5	923 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	FGF14	Q92915	247 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	TMEM143	Q96AN5	459 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	CALML4	Q96GE6	196 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	NLRP4	Q96MN2	994 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	MARCH5	Q9NX47	278 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	KCND2	Q9NZV8	630 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		11.2	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038		F8W810	466 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	GLUD1	P00367	558 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	F13A1	P00488	732 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	ZNF806	P0C7X5	589 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	CYP11B2	P19099	503 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	ARL2	P36404	184 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	TXLNA	P40222	546 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	SLC39A14	Q15043	492 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	PPP2R5A	Q15172	486 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	PTPA	Q15257	358 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	RNF149	Q8NC42	400 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	KIFAP3	Q92845	792 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	CHRD	Q9H2X0	955 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	WASF3	Q9UPY6	502 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		11.19	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	ADAMTS20	P59510	1910 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	PP2D1	A8MPX8	630 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	YEATS4	O95619	227 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	11.18	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	SKI	P12755	728 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	SPINK2	P20155	84 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	PTEN	P60484	403 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	STK38	Q15208	465 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	ECM1	Q16610	540 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	PARM1	Q6UWI2	310 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	CEP68	Q76N32	757 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	PDZD3	Q86UT5	571 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		11.18	□□□□□ -0.62
POLD2-208	ENST00000456038	USP28	Q96RU2	1077 aa		11.18	□□□□□ -0.62

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