RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442312.6

SH3BP2-203, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-203ENST00000442312 IFT43Q96FT9 208 aa13.16□□□□□ -0.3
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SH3BP2-203ENST00000442312 NEU2Q9Y3R4 380 aa13.16□□□□□ -0.3
SH3BP2-203ENST00000442312 ABCB11O95342 1321 aa13.15□□□□□ -0.3
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SH3BP2-203ENST00000442312 KRT27Q7Z3Y8 459 aa13.14□□□□□ -0.31
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SH3BP2-203ENST00000442312 TEX33O43247 280 aa13.14□□□□□ -0.31
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SH3BP2-203ENST00000442312 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 ERVV-1B6SEH8 477 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 TM9SF1O15321 606 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
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SH3BP2-203ENST00000442312 CCDC142Q17RM4 750 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP2-203ENST00000442312 PASD1Q8IV76 773 aa13.14□□□□□ -0.31
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