RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 IKBKEQ14164 716 aa18.31■□□□□ 0.52
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TOP3BP1-201ENST00000420768 KLK14Q9P0G3 267 aa18.3■□□□□ 0.52
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP18.29■□□□□ 0.52
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TAS1R2Q8TE23 839 aa18.29■□□□□ 0.52
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP1R9BQ96SB3 815 aa18.29■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 IL23AQ9NPF7 189 aa18.29■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa18.29■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 MEIS3P2A8K0S8 358 aa18.28■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa18.28■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTGESO14684 152 aa18.28■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 HOXA2O43364 376 aa18.28■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 BAIAP3O94812 1187 aa18.28■□□□□ 0.52
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TPM1P09493 284 aa18.28■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 ACTN1P12814 892 aa18.28■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC9A1P19634 815 aa18.28■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 RFX1P22670 979 aa18.28■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 PIK3CAP42336 1068 aa18.28■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRPC3Q13507 836 aa18.28■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 NCOA4Q13772 614 aa18.28■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTPN21Q16825 1174 aa18.28■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 GLB1LQ6UWU2 654 aa18.28■□□□□ 0.52
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ZFP42Q96MM3 310 aa18.28■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 GAD1Q99259 594 aa18.28■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 EDEM3Q9BZQ6 932 aa18.28■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 IMPG2Q9BZV3 1241 aa18.28■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 DPP3Q9NY33 737 aa18.28■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 FBXL5Q9UKA1 691 aa18.28■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNAH12Q6ZR08 3092 aa18.27■□□□□ 0.52
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1W2PQJ5 194 aa18.27■□□□□ 0.51
TOP3BP1-201ENST00000420768 VNN1O95497 513 aa18.27■□□□□ 0.51
TOP3BP1-201ENST00000420768 THP07101 528 aa18.27■□□□□ 0.51
TOP3BP1-201ENST00000420768 KLK7P49862 253 aa18.27■□□□□ 0.51
TOP3BP1-201ENST00000420768 FPGSQ05932 587 aa18.27■□□□□ 0.51
TOP3BP1-201ENST00000420768 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.51
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