RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 UNC93B1Q9H1C4 597 aa21.92■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 PIK3CAP42336 1068 aa21.91■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 SLC10A6Q3KNW5 377 aa21.91■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 FAM228AQ86W67 206 aa21.91■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 FMNL3Q8IVF7 1028 aa21.91■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 PPM1KQ8N3J5 372 aa21.91■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 PI4K2AQ9BTU6 479 aa21.91■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 ASB7Q9H672 318 aa21.91■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 HAUS4Q9H6D7 363 aa21.91■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP21.91■■□□□ 1.11e-56■■■■■ 327
HDDC3-202ENST00000394272 MROH7Q68CQ1 1323 aa21.91■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 A0A0U1RQJ8 604 aa21.9■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 A0A1W2PQY0 241 aa21.9■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 LACTBL1A8MY62 500 aa21.9■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF263O14978 683 aa21.9■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 EVI5O60447 810 aa21.9■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 NPTXRO95502 500 aa21.9■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 CHRNA1P02708 482 aa21.9■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa21.9■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 SLC43A3Q8NBI5 491 aa21.9■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 ATRIPQ8WXE1 791 aa21.9■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 TATDN2Q93075 761 aa21.9■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 ACAP3Q96P50 834 aa21.9■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 DEF6Q9H4E7 631 aa21.9■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 GFPT2O94808 682 aa21.9■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 C1QTNF8P60827 252 aa21.9■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 GCNT1Q02742 428 aa21.9■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 PTK2Q05397 1052 aa21.9■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 PTK7Q13308 1070 aa21.9■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 NCOA4Q13772 614 aa21.9■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 PTPN14Q15678 1187 aa21.9■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 PHF24Q9UPV7 400 aa21.9■■□□□ 1.1
HDDC3-202ENST00000394272 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa21.89■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 AKR1B10O60218 316 aa21.89■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 CTSHP09668 335 aa21.89■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 MFAP3P55082 362 aa21.89■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 KRT83P78385 493 aa21.89■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 SCARA3Q6AZY7 606 aa21.89■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 SHC3Q92529 594 aa21.89■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 ELMO3Q96BJ8 720 aa21.89■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 FAM81BQ96LP2 452 aa21.89■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 CST3P01034 146 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 NFICP08651 508 aa21.88■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 TMEM191BP0C7N4 346 aa21.88■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 WDR44Q5JSH3 913 aa21.88■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 UBXN11Q5T124 520 aa21.88■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa21.88■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa21.88■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 C1orf112Q9NSG2 853 aa21.88■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 PHACTR2O75167 634 aa21.88■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 THPOP40225 353 aa21.88■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 CYP27A1Q02318 531 aa21.88■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 JADE1Q6IE81 842 aa21.88■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 STARD7Q9NQZ5 370 aa21.88■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 RPS6KA5O75582 802 aa21.87■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 ASS1P00966 412 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 TNNC2P02585 160 aa21.87■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 CCDC172P0C7W6 258 aa21.87■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 TNNT1P13805 278 aa21.87■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 ANXA13P27216 316 aa21.87■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 ARHGAP25P42331 645 aa21.87■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 MTFR1Q15390 333 aa21.87■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 SPA17Q15506 151 aa21.87■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 SLC18A3Q16572 532 aa21.87■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 SPOPLQ6IQ16 392 aa21.87■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF662Q6ZS27 426 aa21.87■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 FAM71AQ8IYT1 594 aa21.87■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa21.87■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 SYT11Q9BT88 431 aa21.87■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa21.87■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 SNTG2Q9NY99 539 aa21.87■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 C2CD2Q9Y426 696 aa21.87■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 KBTBD13C9JR72 458 aa21.86■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 NOP14P78316 857 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 NT5DC4Q86YG4 428 aa21.86■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 CD302Q8IX05 232 aa21.86■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 OLIG1Q8TAK6 271 aa21.86■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 NOD1Q9Y239 953 aa21.86■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 A0A087X0T9 212 aa21.86■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 DNM1LO00429 736 aa21.86■■□□□ 1.09
HDDC3-202ENST00000394272 OFD1O75665 1012 aa21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms