RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393028.5

GIPC1-202, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,483 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-202ENST00000393028 UBN1Q9NPG3 1134 aa30.57■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP30.57■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 TNNI1P19237 187 aa30.56■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 PPP3CAQ08209 521 aa30.56■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 TMEM132DQ14C87 1099 aa30.56■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 OR5B17Q8NGF7 314 aa30.56■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 TOP1MTQ969P6 601 aa30.56■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa30.55■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 GUCY2FP51841 1108 aa30.55■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 SURF1Q15526 300 aa30.55■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 MAN2A1Q16706 1144 aa30.55■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 CD302Q8IX05 232 aa30.55■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa30.55■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF516Q92618 1163 aa30.55■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 MTMR12Q9C0I1 747 aa30.55■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 VPS16Q9H269 839 aa30.55■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 POMCP01189 267 aa30.54■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 KCNE1P15382 129 aa30.54■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 GCLMP48507 274 aa30.54■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 COPB1P53618 953 aaKnown RBP30.54■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 MIIPQ5JXC2 388 aa30.54■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 USP37Q86T82 979 aa30.54■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 WDR49Q8IV35 697 aa30.54■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 ABI1Q8IZP0 508 aa30.54■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa30.54■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 KIAA1671Q9BY89 1806 aa30.53■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 PES1O00541 588 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 NOMO2Q5JPE7 1267 aa30.53■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 CASD1Q96PB1 797 aa30.53■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 GDF15Q99988 308 aa30.53■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 INTS13Q9NVM9 706 aa30.53■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa30.53■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 TBKBP1A7MCY6 615 aa30.52■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 INPPL1O15357 1258 aa30.52■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 TMEM191BP0C7N4 346 aa30.52■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 CLDN10P78369 228 aa30.52■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 FANCCQ00597 558 aa30.52■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 KCNH2Q12809 1159 aa30.52■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 SHHQ15465 462 aa30.52■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 C2CD2Q9Y426 696 aa30.52■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 SCN1AP35498 2009 aa30.52■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 HOXA2O43364 376 aa30.51■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 AFPP02771 609 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.48
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GIPC1-202ENST00000393028 CBWD6Q4V339 395 aa30.51■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 CBWD3Q5JTY5 395 aa30.51■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 CBWD5Q5RIA9 395 aa30.51■■■□□ 2.48
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GIPC1-202ENST00000393028 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 TMEM117Q9H0C3 514 aa30.51■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa30.51■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 HCSTQ9UBK5 93 aa30.51■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 DERAQ9Y315 318 aa30.51■■■□□ 2.48
GIPC1-202ENST00000393028 DGKIO75912 1065 aa30.5■■■□□ 2.47
GIPC1-202ENST00000393028 SERPINC1P01008 464 aa30.5■■■□□ 2.47
GIPC1-202ENST00000393028 PLCB2Q00722 1185 aa30.5■■■□□ 2.47
GIPC1-202ENST00000393028 VWA3BQ502W6 1294 aa30.5■■■□□ 2.47
GIPC1-202ENST00000393028 SCARA3Q6AZY7 606 aa30.5■■■□□ 2.47
GIPC1-202ENST00000393028 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa30.5■■■□□ 2.47
GIPC1-202ENST00000393028 TBC1D13Q9NVG8 400 aa30.5■■■□□ 2.47
GIPC1-202ENST00000393028 CACNG4Q9UBN1 327 aa30.5■■■□□ 2.47
GIPC1-202ENST00000393028 THP07101 528 aa30.5■■■□□ 2.47
GIPC1-202ENST00000393028 FMO5P49326 533 aa30.5■■■□□ 2.47
GIPC1-202ENST00000393028 MXI1P50539 228 aa30.5■■■□□ 2.47
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GIPC1-202ENST00000393028 NAB2Q15742 525 aa30.5■■■□□ 2.47
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GIPC1-202ENST00000393028 MYL7Q01449 175 aa30.49■■■□□ 2.47
GIPC1-202ENST00000393028 BIRC3Q13489 604 aa30.49■■■□□ 2.47
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GIPC1-202ENST00000393028 SV2AQ7L0J3 742 aa30.49■■■□□ 2.47
GIPC1-202ENST00000393028 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
GIPC1-202ENST00000393028 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
GIPC1-202ENST00000393028 TMEM8AQ9HCN3 771 aa30.49■■■□□ 2.47
GIPC1-202ENST00000393028 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
GIPC1-202ENST00000393028 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa30.48■■■□□ 2.47
GIPC1-202ENST00000393028 STX10O60499 249 aa30.48■■■□□ 2.47
GIPC1-202ENST00000393028 TPM2P07951 284 aa30.48■■■□□ 2.47
GIPC1-202ENST00000393028 NT5DC4Q86YG4 428 aa30.48■■■□□ 2.47
GIPC1-202ENST00000393028 C1orf127Q8N9H9 656 aa30.48■■■□□ 2.47
GIPC1-202ENST00000393028 BEST2Q8NFU1 509 aa30.48■■■□□ 2.47
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