RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373793.3

GGTA1P-201, Transcript of glycoprotein, alpha-galactosyltransferase 1 pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GGTA1P, Length 1,544 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTA1P-201ENST00000373793 TMC2Q8TDI7 906 aa28.74■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 ZBED2Q9BTP6 218 aa28.74■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 PLAGL2Q9UPG8 496 aa28.74■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 INPPL1O15357 1258 aa28.73■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 TRIM49P0CI25 452 aa28.73■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 TRIM49CP0CI26 452 aa28.73■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 TNNI1P19237 187 aa28.73■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 BMP8BP34820 402 aa28.73■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 TPM4P67936 248 aa28.73■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 TCERG1LQ5VWI1 586 aa28.73■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 EFCAB13Q8IY85 973 aa28.73■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 THP07101 528 aa28.72■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 ZNF18P17022 549 aa28.72■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 TMEM132DQ14C87 1099 aa28.72■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 TCP11X2Q5H9J9 407 aa28.72■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 YME1L1Q96TA2 773 aa28.72■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 CGRRF1Q99675 332 aa28.72■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 KANSL3Q9P2N6 904 aa28.72■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 C2CD2Q9Y426 696 aa28.72■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 PTPRJQ12913 1337 aa28.71■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 WDR49Q8IV35 697 aa28.71■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 TRIM59Q8IWR1 403 aa28.71■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 FAM84AQ96KN4 292 aa28.71■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 TSPAN18Q96SJ8 248 aa28.71■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 TBC1D13Q9NVG8 400 aa28.71■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 DERAQ9Y315 318 aa28.71■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 COL4A6Q14031 1691 aa28.71■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 ATP1A3P13637 1013 aa28.7■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 ENPEPQ07075 957 aa28.7■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 GRIK3Q13003 919 aa28.7■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 C1orf220Q5T0J3 134 aa28.7■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 CHRDL2Q6WN34 429 aa28.7■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 NT5DC4Q86YG4 428 aa28.7■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 RSPH1Q8WYR4 309 aa28.7■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 RBSNQ9H1K0 784 aa28.7■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 MMRN2Q9H8L6 949 aa28.7■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP28.7■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
GGTA1P-201ENST00000373793 CLDN10P78369 228 aa28.69■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 OR5B17Q8NGF7 314 aa28.69■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 SLC35C1Q96A29 364 aa28.69■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 SLC38A7Q9NVC3 462 aa28.69■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 INTS13Q9NVM9 706 aa28.69■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 TMEM191BP0C7N4 346 aa28.69■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 ZBTB6Q15916 424 aa28.69■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 LRRC43Q8N309 656 aa28.69■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa28.69■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 ZNF516Q92618 1163 aa28.69■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa28.69■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 MTMR12Q9C0I1 747 aa28.69■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa28.69■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 INSL6Q9Y581 213 aa28.69■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 XPOTO43592 962 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 TLL1O43897 1013 aa28.68■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 PPP3CAQ08209 521 aa28.68■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 DUOXA2Q1HG44 320 aa28.68■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 TDHQ8IZJ6 230 aa28.68■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa28.68■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 GRXCR1A8MXD5 290 aa28.67■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 TNNC2P02585 160 aa28.67■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 GCLMP48507 274 aa28.67■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 GUCY2FP51841 1108 aa28.67■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 KRT31Q15323 416 aa28.67■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 NAB2Q15742 525 aa28.67■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 MAN2A1Q16706 1144 aa28.67■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 ZNF280BQ86YH2 543 aa28.67■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 TMEM130Q8N3G9 435 aa28.67■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 BEST2Q8NFU1 509 aa28.67■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 RAD9AQ99638 391 aa28.67■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 TAB2Q9NYJ8 693 aa28.67■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 GBF1Q92538 1859 aa28.67■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 STX10O60499 249 aa28.66■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 RABGGTBP53611 331 aa28.66■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 AP3M2P53677 418 aa28.66■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa28.66■■■□□ 2.18
GGTA1P-201ENST00000373793 DPP3Q9NY33 737 aa28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms