RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 FECHP22830 423 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ACOT2P49753 483 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 APBA1Q02410 837 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 PPP3CAQ08209 521 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 PSMD6Q15008 389 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 TMEM110Q86TL2 294 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 KIAA1524Q8TCG1 905 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 PARD3BQ8TEW8 1205 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CPB2Q96IY4 423 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 MPP4Q96JB8 637 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 PRIMPOLQ96LW4 560 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 GANQ9H2C0 597 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CDHR5Q9HBB8 845 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 PLCB1Q9NQ66 1216 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 TNFSF13BQ9Y275 285 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 P4HA2O15460 535 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ACTN1P12814 892 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 LHX8Q68G74 356 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 USP37Q86T82 979 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 SESTD1Q86VW0 696 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 PAF1Q8N7H5 531 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 OR8K1Q8NGG5 319 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 TCHPQ9BT92 498 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 EDEM3Q9BZQ6 932 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 DNAI2Q9GZS0 605 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 SIX2Q9NPC8 291 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 WBP1LQ9NX94 342 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 OGTO15294 1046 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 PMM2O15305 246 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 TSPAN1O60635 241 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 GTF2H1P32780 548 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 GCLMP48507 274 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 IFT88Q13099 833 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ZNF568Q3ZCX4 644 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 SEZ6Q53EL9 994 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 EEF1DP3Q658K8 133 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 SH3TC2Q8TF17 1288 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CCDC127Q96BQ5 260 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 TMEM117Q9H0C3 514 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 PDZD7Q9H5P4 517 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 PTPN22Q9Y2R2 807 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ANK1P16157 1881 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CABYRO75952 493 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ERLIN2O94905 339 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 FGFR4P22455 802 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ATICP31939 592 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 TNFSF9P41273 254 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 ACLYP53396 1101 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 MAP9Q49MG5 647 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 EPC2Q52LR7 807 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 FAM47CQ5HY64 1035 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 PDXDC1Q6P996 788 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 VPS37AQ8NEZ2 397 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 BAP1Q92560 729 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 OSMRQ99650 979 aa6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CCR6-201ENST00000341935 GRIN2DO15399 1336 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 MOXD2PA6NHM9 499 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 SOWAHDA6NJG2 315 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 LRRC53A6NM62 1247 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 ARHGAP6O43182 974 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 DLATP10515 647 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 MCF2P10911 925 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 DARSP14868 501 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 KCNJ6P48051 423 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 WNT7BP56706 349 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 C1QTNF8P60827 252 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 CLDN10P78369 228 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 CETN1Q12798 172 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 TAF2Q6P1X5 1199 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 TRIM65Q6PJ69 517 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 CYP26C1Q6V0L0 522 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 RRAGAQ7L523 313 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 ZNF710Q8N1W2 664 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 LMO3Q8TAP4 145 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 CDT1Q9H211 546 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 TMEM8AQ9HCN3 771 aa6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms