RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 ATF2P15336 505 aa12□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 SREBF1P36956 1147 aa12□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 CENPCQ03188 943 aa12□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 GNPTABQ3T906 1256 aa12□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 EPC2Q52LR7 807 aa12□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 PRR16Q569H4 304 aa12□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 TMEM154Q6P9G4 183 aa12□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 C4orf50Q6ZRC1 276 aa12□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 SESTD1Q86VW0 696 aa12□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 FAM71AQ8IYT1 594 aa12□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 ATL2Q8NHH9 583 aa12□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 EPS8L1Q8TE68 723 aa12□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 BICD1Q96G01 975 aa12□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 HSD17B14Q9BPX1 270 aa12□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 TUBB6Q9BUF5 446 aa12□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 NUP85Q9BW27 656 aa12□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 PPCSQ9HAB8 311 aa12□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 TUFT1Q9NNX1 390 aa12□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 ANAPC5Q9UJX4 755 aa12□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 FOXO6A8MYZ6 492 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 NVLO15381 856 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 CLDN3O15551 220 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 TRIM49P0CI25 452 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 TRIM49CP0CI26 452 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 POLD1P28340 1107 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 EPHB2P29323 1055 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 NMT1P30419 496 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 CETN1Q12798 172 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 CTC1Q2NKJ3 1217 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 FAM47EQ6ZV65 393 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 MAEAQ7L5Y9 396 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 MYCT1Q8N699 235 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 SUPT20HQ8NEM7 779 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 DCLK3Q9C098 648 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 BCAS3Q9H6U6 928 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 NMRK1Q9NWW6 199 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 C2CD2Q9Y426 696 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 MSH4O15457 936 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 EXOC3O60645 756 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 DLATP10515 647 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 SKIP12755 728 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 IL1R1P14778 569 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 PTP4A2Q12974 167 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 DNAJC3Q13217 504 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 COG2Q14746 738 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 CCDC142Q17RM4 750 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 MUM1Q2TAK8 710 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 QRICH1Q2TAL8 776 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 CCDC89Q8N998 374 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 LRRC8CQ8TDW0 803 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 C1orf54Q8WWF1 131 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 CCDC28BQ9BUN5 200 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 FAM192AQ9GZU8 254 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 CHST7Q9NS84 486 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 LRRC4BQ9NT99 713 aa11.99□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 FAM86B1E9PN63 330 aa11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 EML1O00423 815 aa11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 ENTPD5O75356 428 aa11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 ZWINTO95229 277 aa11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 PDHA1P08559 390 aa11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 CYP3A4P08684 503 aa11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 FAM86B2P0C5J1 330 aa11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 GCAP28676 217 aa11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 C12orf56Q8IXR9 622 aa11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 TTC8Q8TAM2 541 aa11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 KIFAP3Q92845 792 aa11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 CFAP57Q96MR6 1250 aa11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 TTC25Q96NG3 672 aa11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 TIPINQ9BVW5 301 aa11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 IKZF4Q9H2S9 585 aa11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 SCOCQ9UIL1 159 aa11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 MAP3K13O43283 966 aa11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 SLC16A2P36021 539 aa11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 ADCY8P40145 1251 aa11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 CYP2J2P51589 502 aa11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 FMO1Q01740 532 aa11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 GSTA3Q16772 222 aa11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 SEPT14Q6ZU15 432 aa11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 CLNKQ7Z7G1 428 aa11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 ARHGEF19Q8IW93 802 aa11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 GATA6Q92908 595 aa11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 UIMC1Q96RL1 719 aa11.98□□□□□ -0.49
GINS3-202ENST00000328514 RGL1Q9NZL6 768 aa11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms