RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264318.3

GABRA4-201, Transcript of gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha4 subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GABRA4, Length 11,973 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4-201ENST00000264318 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 NR1I3Q14994 352 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 SPANXN2Q5MJ10 180 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 TTC30BQ8N4P2 665 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 C19orf60Q96EN9 201 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 AIFM2Q9BRQ8 373 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 PAG1Q9NWQ8 432 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 ZNF185O15231 689 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 NPTX2P47972 431 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 KCNMA1Q12791 1236 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 KRT79Q5XKE5 535 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 RNF43Q68DV7 783 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 SPOCK3Q9BQ16 436 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 KLC2Q9H0B6 622 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 BLZF1Q9H2G9 400 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 BAIAP2Q9UQB8 552 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 IFNB1P01574 187 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 MAPRE2Q15555 327 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 RAD9BQ6WBX8 426 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 LINGO3P0C6S8 592 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 IL12AP29459 219 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 SOX6P35712 828 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 SCARA3Q6AZY7 606 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 CGREF1Q99674 301 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 ZNF287Q9HBT7 754 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 SH3D21A4FU49 640 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 CLK1P49759 484 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 ESR2Q92731 530 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 GNPTGQ9UJJ9 305 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 ABCC5O15440 1437 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 PPP2R5BQ15173 497 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 C16orf62Q7Z3J2 963 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 KRT28Q7Z3Y7 464 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 PJA1Q8NG27 643 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 PLK2Q9NYY3 685 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 MPP6Q9NZW5 540 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 IGF1RP08069 1367 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 MB21D1Q8N884 522 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 KIF17Q9P2E2 1029 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 GNGT2O14610 69 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 TOMM70O94826 608 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 MARSP56192 900 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 NEK8Q86SG6 692 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 GPAMQ9HCL2 828 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 FANCAO15360 1455 aa10.18□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 ARL4CP56559 192 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 MICALL2Q8IY33 904 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 CABP5Q9NP86 173 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 PCMTD2Q9NV79 361 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 KIAA0232Q92628 1395 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 SHROOM2Q13796 1616 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 RAG1P15918 1043 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 SNX16P57768 344 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 GPBP1Q86WP2 473 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 DOLKQ9UPQ8 538 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 DMRT2Q9Y5R5 561 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 FAM172BPA6NC97 362 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 MORF4L2Q15014 288 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 TXNDC2Q86VQ3 553 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 RAB20Q9NX57 234 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 EFR3BQ9Y2G0 817 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 SMCO2A6NFE2 343 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 GSTA4O15217 222 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 ZNF174Q15697 407 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 DDB1Q16531 1140 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 BARGINQ6ZT62 677 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 SPIRE2Q8WWL2 714 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 TMEM5Q9Y2B1 443 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 RAD51CO43502 376 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 GPD2P43304 727 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 DEPDC1Q5TB30 811 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 CCDC149Q6ZUS6 474 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 C17orf80Q9BSJ5 609 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 ADA2Q9NZK5 511 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 SULT1B1O43704 296 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 PCNAP12004 261 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 MTFR1Q15390 333 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 FAM13AO94988 1023 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 PGM2Q96G03 612 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 PLA2R1Q13018 1463 aa10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
GABRA4-201ENST00000264318 BTBD3Q9Y2F9 522 aa10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms