RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000111980.3

Hoxd4-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd4, Length 1,494 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Hoxd8P23463 289 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Bmp8aP34821 399 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sdc2P43407 202 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 B3gat3P58158 335 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tada2aQ8CHV6 443 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fam151aQ8QZW3 608 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tmem161aQ8VCA6 480 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pcdhb15Q91Y04 786 aa21.38■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Smc1aQ9CU62 1233 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sf3b1Q99NB9 1304 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ppfia4B8QI36 1187 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zfp651E9PZ11 729 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm4307E9PZY4 289 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm4312K9J7E2 289 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mcm5P49718 733 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ccdc85bQ6PDY0 202 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rad9bQ6WBX7 403 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 March6Q6ZQ89 909 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Arhgap11aQ80Y19 987 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tmx1Q8VBT0 278 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Asb7Q91ZU0 318 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 MbipQ99LQ1 341 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cldnd1Q9CQX5 253 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gins2Q9D600 185 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ppp2r3cQ9JK24 453 aa21.37■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 EnamO55196 1274 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Actn3O88990 900 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Vti1aO89116 217 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gdf6P43028 454 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 SnrpfP62307 86 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 H2-Q2Q4KN81 360 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mre11Q61216 706 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Znf579Q80VM4 562 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Wscd1Q80XH4 572 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Usp1Q8BJQ2 784 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tubgcp2Q921G8 905 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Serpinb12Q9D7P9 423 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 CoasyQ9DBL7 563 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dusp10Q9ESS0 483 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sfmbt1Q9JMD1 863 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pla2g2fQ9QZT4 168 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Epm2aQ9WUA5 330 aa21.36■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 ZxdbA2CE44 873 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 P01878 344 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ptpn14Q62130 1189 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Znf365Q8BG89 408 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ccdc38Q8CDN8 563 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Galnt15Q9D2N8 638 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zfyve19Q9DAZ9 389 aa21.35■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Psmc3O88685 442 aa21.34■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Brcc3P46737 291 aa21.34■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cct6aP80317 531 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 MogsQ80UM7 834 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Hgh1Q8C3I8 393 aa21.34■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mss51Q9D5Z5 446 aa21.34■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cst12Q9DAN8 128 aa21.34■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Lcmt1A0A0U1RNF2 332 aa21.33■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cyp2b13A6H6J2 491 aa21.33■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dhx37Q6NZL1 1150 aa21.33■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Arl5cQ6P068 179 aa21.33■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 AtripQ8BMG1 785 aa21.33■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rsph1Q8VIG3 301 aa21.33■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pcdha2Q91Y17 948 aa21.33■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Noa1Q9JJG9 693 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm45208A0A140LJ36 292 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fam129cD3YZB0 591 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pstpip1P97814 415 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cracr2aQ3UP38 310 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 ItgaeQ60677 1167 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mvb12bQ6KAU4 317 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Luc7l2Q7TNC4 392 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 SowahaQ8BLS7 548 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Atg7Q9D906 698 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nmnat1Q9EPA7 285 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Usp29Q9ES63 869 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm13276A0A087WR18 182 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Entpd2O55026 495 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Flt3Q00342 1000 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cyb5r4Q3TDX8 528 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 CochQ62507 552 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pank4Q80YV4 820 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Hook1Q8BIL5 728 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Setdb2Q8C267 713 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mtnr1bQ8CIQ6 364 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rhobtb3Q9CTN4 611 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tmem86aQ9D8N3 241 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dnajc12Q9R022 198 aa21.32■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Atp6v0a1Q9Z1G4 839 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr743L7N1Y2 311 aa21.31■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tnfrsf11aO35305 625 aa21.31■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc7a1Q09143 622 aa21.31■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fam183bQ5NC57 135 aa21.31■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Taf2Q8C176 1104 aa21.31■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Leg1Q8C6C9 337 aa21.31■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tbc1d22aQ8R5A6 516 aa21.31■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Uroc1Q8VC12 676 aa21.31■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sdr42e1Q9D665 394 aa21.31■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tlr5Q9JLF7 859 aa21.31■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Prmt2Q9R144 448 aa21.31■■□□□ 1
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 TfebQ9R210 475 aa21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.7 ms