RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027127.13

Sf3b1-201, Transcript of Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sf3b1, Length 6,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mxra7Q9CZH7 178 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rab11fip1Q9D620 645 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 IkbipQ9DBZ1 373 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tjap1Q9DCD5 539 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Atp13a1Q9EPE9 1200 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Phtf1Q9QZ09 761 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rnf4Q9QZS2 194 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Celf5D3Z4T1 395 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Akr1b10G5E895 316 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Zbtb17Q60821 794 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Celf4Q7TSY6 486 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rassf10Q8BL43 508 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 OgtQ8CGY8 1046 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gnl3Q8CI11 538 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 FktnQ8R507 461 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ube2sQ921J4 223 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fam133bQ9CVI2 245 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pramef12Q9D2F1 463 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 CtsfQ9R013 462 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gyg1Q9R062 333 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Anapc7Q9WVM3 565 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Znf638Q61464 1960 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pgap3A2A559 320 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ttll6A4Q9E8 822 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Irf3P70671 419 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Muc3aQ3U5A2 218 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Nat8lQ3UGX3 299 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pabpn1lQ5XFR0 273 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gemin4Q6P6L6 1058 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fhod1Q6P9Q4 1197 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cep104Q80V31 926 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ankrd45Q810N6 248 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Kbtbd3Q8BHI4 607 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tcaf1Q8BNE1 924 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Snx10Q9CWT3 201 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Kdm8Q9CXT6 414 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rsph3bQ9DA80 389 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 PorcnQ9JJJ7 461 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 RilpQ5ND29 369 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Trim38Q5SZ99 471 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Dlg4Q62108 724 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mtss1Q8R1S4 759 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Prpsap2Q8R574 369 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pcdhgb4Q91XX6 912 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ugp2Q91ZJ5 508 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 1700129C05RikQ9CQ77 218 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mrps22Q9CXW2 359 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Klc4Q9DBS5 619 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ggps1Q9WTN0 300 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ly6iQ9WU67 134 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 C4bP01029 1738 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Astn1Q61137 1302 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Serpinh1P19324 417 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 ZufspQ3T9Z9 577 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mylk3Q3UIZ8 795 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Kctd16Q5DTY9 427 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Soat1Q61263 540 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Styk1Q6J9G1 429 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fam185aQ7TPD2 378 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 RbsnQ80Y56 783 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Q80Y73 168 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ece2Q80Z60 881 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fam204aQ8C6C7 236 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ero1bQ8R2E9 467 aa9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tpd52l2Q9CYZ2 220 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm3415J3QMS8 315 aa8.99□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm21962L7N280 338 aa8.99□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 GclmO09172 274 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cd68P31996 326 aa8.99□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pbxip1Q3TVI8 727 aa8.99□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Hace1Q3U0D9 909 aa8.99□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rgl2Q61193 778 aa8.99□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 CrygnQ8VHL5 183 aa8.99□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ppp1r3aQ99MR9 1089 aa8.99□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Krt20Q9D312 431 aa8.99□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm3404Q9D506 307 aa8.99□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 1700123K08RikQ9D991 295 aa8.99□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pds5aQ6A026 1332 aa8.99□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Acsbg2Q2XU92 667 aa8.99□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Skap2Q3UND0 358 aa8.99□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 CpQ61147 1061 aa8.99□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ntrk3Q6VNS1 825 aa8.99□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tas1r3Q925D8 858 aa8.99□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Strn3Q9ERG2 796 aa8.99□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 GgcxQ9QYC7 757 aa8.99□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Lonrf2B2RT44 518 aa8.99□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ttc17E9PVB5 1198 aa8.99□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Per1O35973 1291 aa8.99□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Sema5aQ62217 1077 aa8.99□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cdk5rap3Q99LM2 503 aa8.99□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tekt1Q9DAJ2 418 aa8.99□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Prl2b1Q9DAZ2 228 aa8.99□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tcirg1Q9JHF5 834 aa8.99□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Drg2Q9QXB9 364 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Bub1bQ9Z1S0 1052 aa8.99□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Dhtkd1A2ATU0 921 aa8.99□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Atp9aO70228 1047 aa8.99□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Lrrc6O88978 473 aa8.99□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 InscQ3HNM7 579 aa8.99□□□□□ -0.97
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Klra7Q60654 280 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.1 ms