RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J YPL108WQ02872 168 aaPredicted RBP2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YMR087WQ04299 284 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YMR254CQ04838 102 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR173WQ06247 608 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J HEM25Q07534 307 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J FRE5Q08908 694 aa2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J LYS21Q12122 440 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J SPS4P09937 338 aa2.16□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YGL041W-AP0C5N3 154 aa2.16□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J CNE1P27825 502 aa2.16□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J IMP1P28627 190 aa2.16□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J AFG1P32317 509 aa2.16□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YBL010CP32788 280 aa2.16□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J PPZ2P33329 710 aa2.16□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J MKS1P34072 584 aa2.16□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YKL063CP35725 167 aa2.16□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J SSZ1P38788 538 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J ERJ5P43613 295 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J UFD1P53044 361 aa2.16□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YGL262WP53054 175 aa2.16□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YGR045CP53229 120 aa2.16□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J COG5P53951 403 aa2.16□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J BUD25P85052 153 aa2.16□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J ARP10Q04549 284 aa2.16□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J SPR28Q04921 423 aa2.16□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J LIP2Q06005 328 aa2.16□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J PEX30Q06169 523 aa2.16□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J ARR2Q06597 130 aa2.16□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J TSR2Q06672 205 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J RFU1Q08003 200 aa2.16□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J MPD1Q12404 318 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J RAX2Q12465 1220 aa2.16□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YPL119C-AQ3E751 87 aa2.16□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR099W-AQ3E798 87 aa2.16□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J YGR035W-AQ45U48 73 aa2.16□□□□□ -2.06
tW(CCA)JtW(CCA)J CDC28P00546 298 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J MET17P06106 444 aa2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J ADK1P07170 222 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J HXT2P23585 541 aa2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J PRE4P30657 266 aa2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J VAM7P32912 316 aa2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J VPS17P32913 551 aa2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J SNC2P33328 115 aa2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J ZRT3P34240 503 aa2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J UMP1P38293 148 aa2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J SDS24P38314 527 aa2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YBR285WP38354 144 aa2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J EGD2P38879 174 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J RIO2P40160 425 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J MDJ2P42834 146 aa2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YJR056CP47115 236 aa2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J TTI2P47168 421 aa2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J SSN8P47821 323 aa2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J VMA10P48836 114 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J SUT1P53032 299 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J SLD3P53135 668 aa2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J FMP48P53233 369 aa2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YGR151CP53287 111 aa2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J SLI1P53304 468 aa2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J PAU12P53343 120 aa2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL21AQ02753 160 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YPL067CQ02754 198 aa2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J MAK3Q03503 176 aa2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YMR166CQ03829 368 aa2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J HLR1Q04429 423 aa2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J ADH6Q04894 360 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J HOF1Q05080 669 aa2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J TMA10Q06177 86 aa2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J ATG17Q06410 417 aa2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J MEU1Q07938 337 aaKnown RBP RIP-Chip data2.15□□□□□ -2.07not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J THP3Q12049 470 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YGK3Q12222 375 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J VAM3Q12241 283 aa2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YOL114CQ12322 202 aa2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J HUT1Q12520 339 aa2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL21BQ12672 160 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YOR192C-CQ3E736 78 aa2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J URA2P07259 2214 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J FUR4P05316 633 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J GDH1P07262 454 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YLL053CP0CD98 152 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J PET122P10355 254 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J FAR1P21268 830 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J PET18P25362 215 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J MIG1P27705 504 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J ARO7P32178 256 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J TCA17P32613 152 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J YNK1P36010 153 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J GLY1P37303 387 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J ADH5P38113 351 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J SWD3P38123 315 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J PAU24P38155 120 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J FIG1P38224 298 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J SOP4P39543 234 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J SSO2P39926 295 aa2.14□□□□□ -2.07
tW(CCA)JtW(CCA)J AVT6P40074 448 aa2.14□□□□□ -2.07
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