RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W PAU15P40585 124 aa9.24□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W NIT2P47016 307 aa9.24□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W MPP6P53725 186 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W BSC5P53755 489 aa9.24□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W RHO3Q00245 231 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W HOF1Q05080 669 aa9.24□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W RTT103Q05543 409 aa9.24□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W COQ10Q08058 207 aa9.24□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W NPC2Q12408 173 aa9.24□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W AIM45Q12480 344 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W SRP102P36057 244 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W YEA6P39953 335 aa9.23□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W BUD8P41698 603 aa9.23□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W AIM24P47127 394 aa9.23□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W FHN1P53279 174 aa9.23□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W MPA43P53583 542 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W YIF1P53845 314 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W PDR16P53860 351 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W OCA2P53949 197 aa9.23□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W EGD1Q02642 157 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W RSM10Q03201 203 aa9.23□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W HAS1Q03532 505 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W MRPL1Q04599 285 aa9.23□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W YDR262WQ12331 272 aa9.23□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W CPR2P23285 205 aa9.22□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W NTF2P33331 125 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W YBR013CP38215 129 aa9.22□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W SLZ1P40167 298 aa9.22□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W RFC2P40348 353 aa9.22□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W TAX4P47030 604 aa9.22□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W AVO1Q08236 1176 aa9.22□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W SRL2Q12020 392 aa9.22□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W MCT1Q12283 360 aa9.22□□□□□ -0.93
PRP4YPR178W QCR2P07257 368 aa9.21□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W PPH21P23594 369 aa9.21□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W LAC1P28496 418 aa9.21□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W PRO1P32264 428 aa9.21□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W ERG3P32353 365 aa9.21□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W SCM4P32564 187 aa9.21□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W MTC7P32633 139 aa9.21□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W CPR5P35176 225 aa9.21□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W FMP46P36141 133 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W UMP1P38293 148 aa9.21□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W MNL1P38888 796 aa9.21□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W SNO2P53823 222 aa9.21□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W NRG1Q03125 231 aa9.21□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W ADD37Q03233 198 aa9.21□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W OPI10Q08202 246 aa9.21□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W MED7Q08278 222 aa9.21□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W BSC6Q08280 497 aa9.21□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W YCT1Q12235 531 aa9.21□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W HIS5P07172 385 aa9.2□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W CTA1P15202 515 aa9.2□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W MED6P38782 295 aa9.2□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W YEA4P40004 342 aa9.2□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W MOB1P40484 314 aa9.2□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W NAS2P40555 220 aa9.2□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W MGA1P53050 456 aa9.2□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W MRX9Q07349 420 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W YPL272CQ08984 517 aa9.2□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W OPI3P05375 206 aa9.19□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W SGA1P08019 549 aa9.19□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W MRPL44P19956 98 aa9.19□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W URK1P27515 501 aa9.19□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W ARO4P32449 370 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W NEM1P38757 446 aa9.19□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W ZIM17P42844 174 aa9.19□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W ERJ5P43613 295 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W AVT4P50944 713 aa9.19□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W YGL114WP53134 725 aa9.19□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W TDA7P53882 636 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W NCE101Q02820 53 aa9.19□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W YLR118CQ12354 227 aa9.19□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W CYT1P07143 309 aa9.18□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W CBP6P07253 162 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W STE18P18852 110 aa9.18□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W OLE1P21147 510 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W POP5P28005 173 aa9.18□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W TRS20P38334 175 aa9.18□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W PAC1P39946 494 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W YER158CP40095 573 aa9.18□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W GPP1P41277 250 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W YGL185CP53100 379 aa9.18□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W RMD9P53140 646 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W YGR066CP53242 292 aa9.18□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W SRP1Q02821 542 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W TPP1Q03796 238 aa9.18□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W GMC1Q04399 608 aa9.18□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W ASM4Q05166 528 aa9.18□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W BNA5Q05979 453 aa9.18□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W IRC13Q08630 104 aa9.18□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W RLM1Q12224 676 aa9.18□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W NAG1Q8TGN9 163 aa9.18□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W RFA3P26755 122 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W FAA1P30624 700 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
PRP4YPR178W NRP1P32770 719 aaKnown RBP RIP-Chip data9.17□□□□□ -0.94not detected
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