RNA–Protein interactions for RNA: YPR013C

CMR3, Transcript of Putative zinc finger protein, yeast

Gene CMR3, Length 954 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CMR3	YPR013C	CDD1	Q06549	142 aa		3.5	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	YOL029C	Q08187	201 aa		3.5	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	RAX2	Q12465	1220 aa		3.5	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	PHO80	P20052	293 aa		3.49	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	PPH21	P23594	369 aa		3.49	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	ERG2	P32352	222 aa		3.49	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	CPR7	P47103	393 aa		3.49	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	BRR6	P53062	197 aa		3.49	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	DIA1	P54005	336 aa		3.49	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	YLR152C	P54072	576 aa		3.49	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		3.49	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	PSK1	P31374	1356 aa		3.49	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	URA6	P15700	204 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	ECM34	P38728	170 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	IRC18	P47056	224 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	YJR149W	P47177	404 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	MRH4	P53166	561 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	GIM5	Q04493	163 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	GPM2	Q12008	311 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	TPO4	Q12256	659 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	BMT5	P40493	336 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	YGL262W	P53054	175 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	MRPS16	Q02608	121 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	GOT1	Q03554	138 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	YDR124W	Q04608	324 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	ECM19	Q06011	112 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	TUS1	Q06412	1307 aa		3.46	□□□□□ -1.85
CMR3	YPR013C	COS2	P0CX12	379 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	COS3	P0CX13	379 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	MEP2	P41948	499 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	COS4	P43542	379 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	RPE1	P46969	238 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	PGU1	P47180	361 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	OST3	P48439	350 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	NNT1	Q05874	261 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	YOR186W	Q08560	144 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	AST1	P35183	429 aa		3.45	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	CSG2	P35206	410 aa		3.45	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	VPS51	P36116	164 aa		3.45	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	SDT1	P53078	280 aa		3.45	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	YNL046W	P53956	172 aa		3.45	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	MCH1	Q07376	486 aa		3.45	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	YPL150W	Q12152	901 aa		3.45	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	COX5A	P00424	153 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	ERD2	P18414	219 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	YEL045C	P32616	141 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	YCR087C-A	P37263	153 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	ARN2	P38724	620 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	SYS1	P41544	203 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	TOS8	P53147	276 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	CAX4	P53223	239 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	PDR17	P53844	350 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	FUS2	Q05670	677 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	YPS3	Q12303	508 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	MRX4	Q12467	430 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	SRY1	P36007	326 aa		3.43	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	UFE1	P41834	346 aa		3.43	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	ATG5	Q12380	294 aa		3.43	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	YOL085C	Q99345	113 aa		3.43	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	FLO11	P08640	1367 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	SNF6	P18888	332 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	DBF2	P22204	572 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	RPB9	P27999	122 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	SPS18	P32572	300 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.42	□□□□□ -1.86	not detected
CMR3	YPR013C	YHL044W	P38727	235 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	BXI1	P48558	297 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	UFD1	P53044	361 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	YGL034C	P53186	121 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	TVP15	Q03860	143 aa		3.42	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	DRS2	P39524	1355 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	MET2	P08465	486 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	COX10	P21592	462 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	PRY2	P36110	329 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	YJL016W	P47072	561 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	MMS2	P53152	137 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	YGR018C	P53211	109 aa		3.41	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
CMR3	YPR013C	YPL039W	Q03080	316 aa		3.41	□□□□□ -1.86

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