RNA–Protein interactions for RNA: YOR116C

RPO31, Transcript of RNA polymerase III largest subunit C160, yeast

Gene RPO31, Length 4,383 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPO31	YOR116C	QCR2	P07257	368 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	YCL002C	P25565	263 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	PAU2	P32612	120 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	SNC2	P33328	115 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	PSD1	P39006	500 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	YER158C	P40095	573 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	DOC1	P53068	250 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	YGR012W	P53206	393 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	FRE8	Q12209	686 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	ODC2	Q99297	307 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	YCR102C	P25608	368 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	PRO1	P32264	428 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	SDH8	P38345	138 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	GET2	P40056	285 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	YGL117W	P53133	265 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	NAT4	Q04751	285 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	YOL019W	Q08157	551 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	ATX2	Q12067	313 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	PET20	Q99373	253 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	FUS1	P11710	512 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	YCR061W	P25639	631 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	MRPS9	P38120	278 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	CYB5	P40312	120 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	RFC2	P40348	353 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	AIM11	P87275	137 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	INP1	Q03694	420 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	MSS11	Q03825	758 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	XYL2	Q07993	356 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	INP53	Q12271	1107 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	YDR262W	Q12331	272 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	PEX11	Q12462	236 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	POP5	P28005	173 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	PPG1	P32838	368 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	EMC3	P36039	253 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	OMA1	P36163	345 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	SOL3	P38858	249 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	SOL1	P50278	321 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	PGA1	P53896	198 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	DYN2	Q02647	92 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	GOT1	Q03554	138 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	TVP18	Q04767	167 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	YDR286C	Q05530	114 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	COQ11	Q05892	277 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	YPR098C	Q06089	161 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	SWM1	Q12379	170 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	HIP1	P06775	603 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	YKR104W	P0CE69	306 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	SPO13	P23624	291 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	APS1	P35181	156 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	CLG1	P35190	452 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	SPG5	P42933	373 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	YFR045W	P43617	309 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	YNR048W	P53740	393 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	ELC1	Q03071	99 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	NUP53	Q03790	475 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	KEI1	Q06346	221 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	RRT7	Q07829	113 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	ATG40	Q99325	256 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.51	□□□□□ -1.85	not detected
RPO31	YOR116C	COQ3	P27680	312 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	LDB7	P38210	180 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	FAU1	P40099	211 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	VNX1	P42839	908 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	TAD2	P47058	250 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	PAU12	P53343	120 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	LPP1	Q04396	274 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	CRR1	Q05790	422 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	MRPL35	Q06678	367 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	ICT1	Q12385	394 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	CHS1	P08004	1131 aa		3.5	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	SFC1	P33303	322 aa		3.5	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	YKL162C	P36052	402 aa		3.5	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	GMH1	P36125	273 aa		3.5	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	BAP2	P38084	609 aa		3.5	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	AGE2	P40529	298 aa		3.5	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	APQ12	P40532	138 aa		3.5	□□□□□ -1.85

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