RNA–Protein interactions for RNA: YOL089C

HAL9, Transcript of Putative transcription factor containing a zinc finger, yeastyeast

Gene HAL9, Length 3,093 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HAL9YOL089C YPL247CQ12523 523 aa0.34□□□□□ -2.35
HAL9YOL089C ADH3P07246 375 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C POX1P13711 748 aa0.34□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C SCO1P23833 295 aa0.34□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C DAL80P26343 269 aa0.34□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C AEP1P32493 518 aa0.34□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C YHB1P39676 399 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C COA1P40452 197 aa0.34□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C ERG25P53045 309 aa0.34□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C KAP114P53067 1004 aa0.34□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C YOR1P53049 1477 aa0.34□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C IPP1P00817 287 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C RPL24AP04449 155 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C FCY2P17064 533 aa0.34□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C YHL049CP38722 271 aa0.34□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C EGD1Q02642 157 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C EMI1Q04406 187 aa0.34□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C YMR114CQ04471 368 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C ATG17Q06410 417 aa0.34□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C ARO1P08566 1588 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C FLO9P39712 1322 aa0.34□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C DOA4P32571 926 aa0.33□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C HMT1P38074 348 aa0.33□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C PGD1P40356 397 aa0.33□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C SHQ1P40486 507 aaPredicted RBP0.33□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C NAS2P40555 220 aa0.33□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C YJR146WP47174 117 aa0.33□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C ACT1P60010 375 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP0.33□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C SRB8P25648 1427 aa0.33□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C KRR1P25586 316 aaPredicted RBP0.33□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C PEX3P28795 441 aa0.33□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C YKL070WP36087 169 aa0.33□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C YHL044WP38727 235 aa0.33□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C YJL016WP47072 561 aa0.33□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C MDM34P53083 459 aa0.33□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C CYT2Q00873 224 aa0.33□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C SPO19Q03029 223 aa0.33□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C ATC1Q04005 294 aa0.33□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C SNU23Q12368 194 aaPredicted RBP0.33□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C YAL064W-BO13512 126 aa0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C YPR170W-BP0C5R9 85 aa0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C RPL4AP10664 362 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C ZWF1P11412 505 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C ERG24P32462 438 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C CLB6P32943 380 aa0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C MSA2P36157 363 aa0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C YHI9P38765 294 aa0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C TEM1P38987 245 aa0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C RCY1P39531 840 aa0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C GLE2P40066 365 aa0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C YMR144WP40214 342 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C BNA6P43619 295 aa0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C RPL4BP49626 362 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C ADH6Q04894 360 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C COX20Q04935 205 aa0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C YPR098CQ06089 161 aa0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C CTS2Q06350 511 aa0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C YPL257WQ08974 193 aa0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C TDH2P00358 332 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C RPL9AP05738 191 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C SEC22P22214 214 aa0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C VPS3P23643 1011 aa0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C MEK1P24719 497 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C YOR062CP36025 268 aa0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C FIS1P40515 155 aa0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C GCD14P46959 383 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C RPL9BP51401 191 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C MRPL50P53724 139 aa0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C YDR124WQ04608 324 aa0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C YOR283WQ12040 230 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C SSA3P09435 649 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C QRI5P32344 111 aa0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C YHR125WP38831 101 aa0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C SNZ2P53824 298 aa0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C YMD8Q03697 442 aa0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C ATG39Q06159 398 aa0.32□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C TOP2P06786 1428 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C SIR4P11978 1358 aa0.31□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C YKR104WP0CE69 306 aa0.31□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C YOL162WP0CF19 215 aa0.31□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C DSF1P0CX08 502 aa0.31□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C YNR073CP0CX09 502 aa0.31□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C JEN1P36035 616 aa0.31□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C YHR127WP38833 243 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data0.31□□□□□ -2.36not detected
HAL9YOL089C YGR026WP53217 278 aa0.31□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C VBA1Q04301 562 aa0.31□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C ERV41Q04651 352 aa0.31□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C YBL112CQ3E7Y4 105 aa0.31□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C ATP6P00854 259 aa0.31□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C MSW1P04803 379 aa0.31□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C QCR8P08525 94 aa0.31□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C FBA1P14540 359 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C DAL82P21705 255 aa0.31□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C RNA15P25299 296 aaPredicted RBP0.31□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C MSN4P33749 630 aa0.31□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C CSG2P35206 410 aa0.31□□□□□ -2.36
HAL9YOL089C FZO1P38297 855 aa0.31□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.5 ms