RNA–Protein interactions for RNA: YOL073C

DSC2, Transcript of Multi-transmembrane subunit of the DSC ubiquitin ligase complex, yeast

Gene DSC2, Length 969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSC2	YOL073C	AIM2	P39721	246 aa		3.55	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	COG3	P40094	801 aa		3.55	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	VHS2	P40463	436 aa		3.55	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	YIR020C	P40575	100 aa		3.55	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	ATG18	P43601	500 aa		3.55	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	GTO1	P48239	356 aa		3.55	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	SIP18	P50263	79 aa		3.55	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	AIF1	P52923	378 aa		3.55	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	SLM2	P53955	656 aa		3.55	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	YMR209C	Q03648	457 aa		3.55	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	GMC1	Q04399	608 aa		3.55	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	COX20	Q04935	205 aa		3.55	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	SML1	Q04964	104 aa		3.55	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	PIN3	Q06449	215 aa		3.55	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	CBF1	P17106	351 aa		3.54	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	PEX18	P38855	283 aa		3.54	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	ATG7	P38862	630 aa		3.54	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	PEP8	P40335	379 aa		3.54	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	YDR476C	Q03362	224 aa		3.54	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	RCE1	Q03530	315 aa		3.54	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	IRC19	Q07843	230 aa		3.54	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	GRE1	Q08969	168 aa		3.54	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	UNG1	P12887	359 aa		3.53	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	TFS1	P14306	219 aa		3.53	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	YEL043W	P32618	956 aa		3.53	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	ECM14	P38836	430 aa		3.53	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	PAC10	P48363	199 aa		3.53	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	NAS6	P50086	228 aa		3.53	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	CDH1	P53197	566 aa		3.53	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	SPR6	Q01684	191 aa		3.53	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	SNX41	Q04053	625 aa		3.53	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	NDL1	Q06568	189 aa		3.53	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	UAF30	Q08747	228 aa		3.53	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	RTR2	Q12378	196 aa		3.53	□□□□□ -1.84
DSC2	YOL073C	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	DAL80	P26343	269 aa		3.52	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	TCA17	P32613	152 aa		3.52	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	GPI18	P38211	433 aa		3.52	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	PHO89	P38361	574 aa		3.52	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	YHR180W	P38868	163 aa		3.52	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	YHC3	P47040	408 aa		3.52	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	NAT4	Q04751	285 aa		3.52	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	STE23	Q06010	1027 aa		3.52	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	YPR202W	Q08993	238 aa		3.52	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	ISA2	Q12425	185 aa		3.52	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	ERP4	Q12450	207 aa		3.52	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		3.52	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		3.52	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	FSH3	Q99369	266 aa		3.52	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	YAL064W-B	O13512	126 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	YPR096C	O13587	100 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	CTA1	P15202	515 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	UGA1	P17649	471 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.51	□□□□□ -1.85	not detected
DSC2	YOL073C	SEC17	P32602	292 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	PRY2	P36110	329 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	CAF4	P36130	643 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	BIO4	P53630	237 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	SED1	Q01589	338 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	PET191	Q02772	108 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	CSI2	Q08054	341 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	YDL109C	Q12103	647 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	MCP1	Q12106	302 aa		3.51	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	CDC8	P00572	216 aa		3.5	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	CPR2	P23285	205 aa		3.5	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	SCO1	P23833	295 aa		3.5	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	STP2	P38704	541 aa		3.5	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	UBC13	P52490	153 aa		3.5	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	YNL046W	P53956	172 aa		3.5	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	YDR124W	Q04608	324 aa		3.5	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	MCH1	Q07376	486 aa		3.5	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	MFG1	Q07684	458 aa		3.5	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	DEP1	P31385	405 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	YBR096W	P38256	230 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	YER084W	P40057	128 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	YNL320W	P42840	284 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	YPS5	P53057	165 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	COS6	P53344	381 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	INP1	Q03694	420 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	RIM9	Q04734	239 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	UIP4	Q08926	304 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	YLR053C	Q12026	108 aa		3.49	□□□□□ -1.85
DSC2	YOL073C	SAS5	Q99314	248 aa		3.49	□□□□□ -1.85

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