RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623316.1

ATRX-210, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 5

Gene ATRX, Length 803 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-210ENST00000623316 B3GALT2O43825 422 aa7.16□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 TCEA3O75764 348 aa7.16□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 PNLIPP16233 465 aa7.16□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 PTGS1P23219 599 aa7.16□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 GALK1P51570 392 aa7.16□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 ERVFC1P60507 584 aa7.16□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 PAQR3Q6TCH7 311 aa7.16□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 LYSMD2Q8IV50 215 aa7.16□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 ACRBPQ8NEB7 543 aa7.16□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 CALML6Q8TD86 181 aa7.16□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 NRG4Q8WWG1 115 aa7.16□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 FATE1Q969F0 183 aa7.16□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 B3GNT5Q9BYG0 378 aa7.16□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa7.16□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa7.16□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 DMTF1Q9Y222 760 aa7.16□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 CDY2AQ9Y6F7 541 aa7.16□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 C4BP0C0L5 1744 aa7.15□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 NFIBO00712 420 aa7.15□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 MAFGO15525 162 aa7.15□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 PPFIA4O75335 1185 aa7.15□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 ALDH2P05091 517 aa7.15□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 SLC5A1P13866 664 aa7.15□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 FUT4P22083 530 aa7.15□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 TRAPPC10P48553 1259 aa7.15□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 MALLQ13021 153 aa7.15□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 SEMA5AQ13591 1074 aa7.15□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 TIGD5Q53EQ6 642 aa7.15□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 CD276Q5ZPR3 534 aa7.15□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 NPNTQ6UXI9 565 aa7.15□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 LILRA2Q8N149 483 aa7.15□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 FLAD1Q8NFF5 587 aa7.15□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 PPM1EQ8WY54 764 aa7.15□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 MTG2Q9H4K7 406 aa7.15□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 SLC39A2Q9NP94 309 aa7.15□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 DTLQ9NZJ0 730 aa7.15□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 DENND2AQ9ULE3 1009 aa7.15□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 USP16Q9Y5T5 823 aa7.15□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 HEG1Q9ULI3 1381 aa7.15□□□□□ -1.26
ATRX-210ENST00000623316 ZNF831Q5JPB2 1677 aa7.15□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa7.15□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 SH3BP5O60239 455 aa7.14□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 C5P01031 1676 aa7.14□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 HPXP02790 462 aa7.14□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 EDNRBP24530 442 aa7.14□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 HTR1BP28222 390 aa7.14□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 CACNB3P54284 484 aa7.14□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 STK3Q13188 491 aa7.14□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 SLC9A5Q14940 896 aa7.14□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 ADRM1Q16186 407 aa7.14□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.14□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 CEP350Q5VT06 3117 aa7.14□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 RNF220Q5VTB9 566 aa7.14□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 ANO1Q5XXA6 986 aa7.14□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 ERAP2Q6P179 960 aa7.14□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 XRRA1Q6P2D8 792 aa7.14□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 SKAP1Q86WV1 359 aa7.14□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa7.14□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa7.14□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 GAB3Q8WWW8 586 aa7.14□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 CGRRF1Q99675 332 aa7.14□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 APOL5Q9BWW9 433 aa7.14□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 UBA5Q9GZZ9 404 aa7.14□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 BHMT2Q9H2M3 363 aa7.14□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa7.14□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa7.14□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 IPPQ9Y573 584 aa7.14□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 TJP1Q07157 1748 aa7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 QSER1Q2KHR3 1735 aa7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 GOLIM4O00461 696 aa7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 CHL1O00533 1208 aa7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 DYRK3O43781 588 aa7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 MPIG6BO95866 241 aa7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 A1BGP04217 495 aa7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 CELA3BP08861 270 aa7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 SETSIPP0DME0 302 aa7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 GYS1P13807 737 aa7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 RAC2P15153 192 aa7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 EIF5P55010 431 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 RAPGEF1Q13905 1077 aa7.13□□□□□ -1.27
ATRX-210ENST00000623316 SNX17Q15036 470 aa7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms