RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, human

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA3B-215	ENST00000621029	SPECC1	Q5M775	1068 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	RAD54L	Q92698	747 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	REEP2	Q9BRK0	252 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	MTMR6	Q9Y217	621 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029		H0YCG3	227 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	STX6	O43752	255 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	GLUD1	P00367	558 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	PTPA	Q15257	358 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	PALB2	Q86YC2	1186 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	MYCT1	Q8N699	235 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	BICD1	Q96G01	975 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	31.77	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		31.77	■■■□□ 2.68
SEMA3B-215	ENST00000621029	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	31.76	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	NAB2	Q15742	525 aa		31.76	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	EPSTI1	Q96J88	318 aa		31.76	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	31.76	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	ACAP3	Q96P50	834 aa		31.76	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	31.76	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		31.76	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	DPP7	Q9UHL4	492 aa		31.76	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	TOM1L1	O75674	476 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	SPATA31D3	P0C874	917 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	TXLNA	P40222	546 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	CREM	Q03060	361 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	HSCB	Q8IWL3	235 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	LRRC15	Q8TF66	581 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	31.75	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	PRR33	A8MZF0	331 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	B3GAT3	O94766	335 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	31.74	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	PROZ	P22891	400 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	31.74	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	31.74	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	USP49	Q70CQ1	688 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	PARVG	Q9HBI0	331 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	31.74	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029		K7ENM7	598 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	CLDN3	O15551	220 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	NCKAP1L	P55160	1127 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	31.73	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	RTP2	Q5QGT7	225 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZPBP2	Q6X784	338 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	GPR149	Q86SP6	731 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	SNX21	Q969T3	373 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	UROC1	Q96N76	676 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	CLIC6	Q96NY7	704 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		31.73	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	DDIT3	P35638	169 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	CLCNKB	P51801	687 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	SEZ6	Q53EL9	994 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	GPR65	Q8IYL9	337 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	EDA	Q92838	391 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	SNX27	Q96L92	541 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	USP28	Q96RU2	1077 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	FNIP2	Q9P278	1114 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		31.72	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	ABLIM1	O14639	778 aa		31.71	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	BRD1	O95696	1058 aa		31.71	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	LIG4	P49917	911 aa		31.71	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		31.71	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	31.71	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	TRAK2	O60296	914 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	31.7	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		31.7	■■■□□ 2.67
SEMA3B-215	ENST00000621029	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SEMA3B-215	ENST00000621029	TGM5	O43548	720 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SEMA3B-215	ENST00000621029	PSMD5	Q16401	504 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SEMA3B-215	ENST00000621029	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	31.69	■■■□□ 2.66
SEMA3B-215	ENST00000621029	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SEMA3B-215	ENST00000621029	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	31.69	■■■□□ 2.66
SEMA3B-215	ENST00000621029	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SEMA3B-215	ENST00000621029	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
SEMA3B-215	ENST00000621029	TBX20	Q9UMR3	447 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SEMA3B-215	ENST00000621029	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	31.68	■■■□□ 2.66
SEMA3B-215	ENST00000621029	TRAPPC3	O43617	180 aa		31.68	■■■□□ 2.66
SEMA3B-215	ENST00000621029	ZXDA	P98168	799 aa		31.68	■■■□□ 2.66
SEMA3B-215	ENST00000621029	MCL1	Q07820	350 aa		31.68	■■■□□ 2.66
SEMA3B-215	ENST00000621029	SLC39A14	Q15043	492 aa		31.68	■■■□□ 2.66
SEMA3B-215	ENST00000621029	STK38	Q15208	465 aa		31.68	■■■□□ 2.66

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms