RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591989.5

NEDD4L-233, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene NEDD4L, Length 233 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-233	ENST00000591989	STRN3	Q13033	797 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	REST	Q13127	1097 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	TUSC3	Q13454	348 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	FUT10	Q6P4F1	479 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	GPBP1	Q86WP2	473 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	HASPIN	Q8TF76	798 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	SUSD6	Q92537	303 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZNF292	O60281	2723 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	PROB1	E7EW31	1015 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	SLC26A4	O43511	780 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	LILRB3	O75022	631 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	PLCG1	P19174	1290 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24	8e-7	■■■■■ 28.5
NEDD4L-233	ENST00000591989	CLCN4	P51793	760 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	ITIH3	Q06033	890 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	MCM6	Q14566	821 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	USP41	Q3LFD5	358 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	ARSH	Q5FYA8	562 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	CEP57	Q86XR8	500 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	CEP120	Q8N960	986 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	ATOH1	Q92858	354 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	EPSTI1	Q96J88	318 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	CDT1	Q9H211	546 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	KCND2	Q9NZV8	630 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	MTMR6	Q9Y217	621 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	CIT	O14578	2027 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989		H0Y858	1186 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	TEX28	O15482	410 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	STX6	O43752	255 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM13A	O94988	1023 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	ADH1A	P07327	375 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	SPATA31D3	P0C874	917 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	AVPR2	P30518	371 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	GRM5	P41594	1212 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	DSG1	Q02413	1049 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	PTPA	Q15257	358 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	USP49	Q70CQ1	688 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	PALB2	Q86YC2	1186 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	HSCB	Q8IWL3	235 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	MYCT1	Q8N699	235 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	LRRC15	Q8TF66	581 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	RAD54L	Q92698	747 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	BICD1	Q96G01	975 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	CLIC6	Q96NY7	704 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	ACAP3	Q96P50	834 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	REEP2	Q9BRK0	252 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	POMK	Q9H5K3	350 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	FRYL	O94915	3013 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	PRR23A	A6NEV1	266 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	KIF4A	O95239	1232 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	EFEMP2	O95967	443 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	MTHFR	P42898	656 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	SEZ6	Q53EL9	994 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	SNX21	Q969T3	373 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NEDD4L-233	ENST00000591989	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		13.55	□□□□□ -0.24

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