RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
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CTIF-205ENST00000587860 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa16.14■□□□□ 0.17
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CTIF-205ENST00000587860 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
CTIF-205ENST00000587860 GJB1P08034 283 aa16.11■□□□□ 0.17
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