RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579743.2

GGA3-208, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-208	ENST00000579743	B3GAT3	O94766	335 aa		15.06	■□□□□ 0
GGA3-208	ENST00000579743	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	15.06	■□□□□ 0
GGA3-208	ENST00000579743	MYB	P10242	640 aa		15.06	■□□□□ 0
GGA3-208	ENST00000579743	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	15.06	■□□□□ 0
GGA3-208	ENST00000579743	NBR1	Q14596	966 aa		15.06	■□□□□ 0
GGA3-208	ENST00000579743	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	15.06	■□□□□ 0
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		15.06	■□□□□ 0
GGA3-208	ENST00000579743	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		15.06	■□□□□ 0
GGA3-208	ENST00000579743	HASPIN	Q8TF76	798 aa		15.06	■□□□□ 0
GGA3-208	ENST00000579743	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		15.06	■□□□□ 0
GGA3-208	ENST00000579743	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		15.06	■□□□□ 0
GGA3-208	ENST00000579743		E9PMD0	336 aa		15.05	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743		H0YCG3	227 aa		15.05	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	PTGES	O14684	152 aa		15.05	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	15.05	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	HIP1R	O75146	1068 aa		15.05	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	KIF4A	O95239	1232 aa		15.05	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	15.05	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	NPTX2	P47972	431 aa		15.05	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	RTP2	Q5QGT7	225 aa		15.05	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	LILRA6	Q6PI73	481 aa		15.05	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	15.05	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		15.05	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	RTL10	Q7L3V2	364 aa		15.05	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	FLCN	Q8NFG4	579 aa		15.05	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	KIF2C	Q99661	725 aa		15.05	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		15.05	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		15.05	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		15.05	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	15.05	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	KCND2	Q9NZV8	630 aa		15.05	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	15.05	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		15.05	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		15.04	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		15.04	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	15.04	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	MCF2	P10911	925 aa		15.04	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	FSHR	P23945	695 aa		15.04	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	HOXA9	P31269	272 aa		15.04	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	GRM5	P41594	1212 aa		15.04	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	15.04	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	TCF15	Q12870	199 aa		15.04	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	ECM1	Q16610	540 aa		15.04	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	UVSSA	Q2YD98	709 aa		15.04	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	C8orf34	Q49A92	452 aa		15.04	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		15.04	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		15.04	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	15.04	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		15.04	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	ACAP3	Q96P50	834 aa		15.04	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	15.04	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	WNT16	Q9UBV4	365 aa		15.04	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		15.04	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	POLI	Q9UNA4	740 aa		15.04	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		15.04	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	15.04	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	C5orf42	Q9H799	3197 aa		15.04	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	SLC26A4	O43511	780 aa		15.03	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	PAPLN	O95428	1278 aa		15.03	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	BMP15	O95972	392 aa		15.03	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	C8A	P07357	584 aa		15.03	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	SCP2	P22307	547 aa		15.03	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	GUCY2C	P25092	1073 aa		15.03	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	ELF1	P32519	619 aa		15.03	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	15.03	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		15.03	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		15.03	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	15.03	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	SIX5	Q8N196	739 aa		15.03	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	15.03	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	15.03	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	CALML4	Q96GE6	196 aa		15.03	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	15.03	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		15.03	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	POLD4	Q9HCU8	107 aa		15.03	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	15.03	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		15.03	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	USP20	Q9Y2K6	914 aa		15.03	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		15.03	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		15.03	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	15.02	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		15.02	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743		H7C4K7	107 aa		15.02	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	SRF	P11831	508 aa		15.02	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	LAMP2	P13473	410 aa		15.02	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	FGFR3	P22607	806 aa		15.02	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	GJB2	P29033	226 aa		15.02	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	15.02	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	OR1D2	P34982	312 aa		15.02	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	15.02	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	OSTN	P61366	133 aa		15.02	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	RAB33A	Q14088	237 aa		15.02	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	NAB2	Q15742	525 aa		15.02	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	KYAT1	Q16773	422 aa		15.02	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		15.02	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	MTSS1L	Q765P7	747 aa		15.02	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		15.02	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		15.02	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		15.02	■□□□□ -0
GGA3-208	ENST00000579743	TMX3	Q96JJ7	454 aa		15.02	■□□□□ -0

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