RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	19.72	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		19.72	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	MYBL1	P10243	752 aa		19.72	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	19.72	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	19.72	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	19.72	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	SV2A	Q7L0J3	742 aa		19.72	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	19.72	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	GPD1L	Q8N335	351 aa		19.72	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		19.72	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	19.72	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		19.72	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	19.72	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	ACP6	Q9NPH0	428 aa		19.72	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	19.72	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	FSCN2	O14926	492 aa		19.71	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	CCND2	P30279	289 aa		19.71	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	SLC1A1	P43005	524 aa		19.71	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	BPIFB4	P59827	614 aa		19.71	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	TNFAIP1	Q13829	316 aa		19.71	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R7	Q15435	360 aa		19.71	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	CEP170P1	Q96L14	293 aa		19.71	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	19.71	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		19.71	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	19.71	■□□□□ 0.75	5e-6	■■■■□ 23.1
RRN3-205	ENST00000563559	WHRN	Q9P202	907 aa		19.71	■□□□□ 0.75
RRN3-205	ENST00000563559	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	19.7	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		19.7	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	TLDC2	A0PJX2	215 aa		19.7	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	RIPK2	O43353	540 aa		19.7	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	GRIN3B	O60391	1043 aa		19.7	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	19.7	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	KRT5	P13647	590 aa		19.7	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	MAPK4	P31152	587 aa		19.7	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	19.7	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	19.7	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	BTBD6	Q96KE9	485 aa		19.7	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		19.7	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		19.7	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	19.7	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		19.7	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	19.7	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	DGAT1	O75907	488 aa		19.7	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		19.7	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		19.7	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		19.7	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	CEP89	Q96ST8	783 aa		19.7	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		19.7	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		19.69	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	19.69	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	CHN1	P15882	459 aa		19.69	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	DRD4	P21917	467 aa		19.69	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	19.69	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	QPCT	Q16769	361 aa		19.69	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	19.69	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	SGO2	Q562F6	1265 aa		19.69	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		19.69	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		19.69	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	NSMF	Q6X4W1	530 aa		19.69	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	IFT74	Q96LB3	600 aa		19.69	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	AZI2	Q9H6S1	392 aa		19.69	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		19.69	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		19.69	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		19.69	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	RASGRF2	O14827	1237 aa		19.69	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	ITIH2	P19823	946 aa		19.69	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	SCP2	P22307	547 aa		19.69	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	MFSD5	Q6N075	450 aa		19.69	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		19.69	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	MDM1	Q8TC05	714 aa		19.69	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		19.69	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	19.69	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		19.69	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	19.69	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		19.69	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	CLDN3	O15551	220 aa		19.68	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	PSAP	P07602	524 aa		19.68	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	19.68	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		19.68	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	BSND	Q8WZ55	320 aa		19.68	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	BICD1	Q96G01	975 aa		19.68	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		19.68	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		19.68	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	STK32B	Q9NY57	414 aa		19.68	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	COL4A5	P29400	1685 aa		19.68	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	VWA5A	O00534	786 aa		19.67	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	NR3C2	P08235	984 aa		19.67	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	FGFR4	P22455	802 aa		19.67	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	CAV1	Q03135	178 aa		19.67	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		19.67	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	WDR44	Q5JSH3	913 aa		19.67	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	19.67	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		19.67	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		19.67	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	CDHR1	Q96JP9	859 aa		19.67	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		19.67	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	19.67	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	19.67	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	ASAP2	O43150	1006 aa		19.67	■□□□□ 0.74
RRN3-205	ENST00000563559	GAS8	O95995	478 aa		19.67	■□□□□ 0.74

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