RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559737.5

USP3-AS1-203, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3-AS1, Length 1,434 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-203ENST00000559737 LUZP1Q86V48 1076 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 GAS2L3Q86XJ1 694 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM200AQ8TCP9 573 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 PLEKHO2Q8TD55 490 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 SNX27Q96L92 541 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 MFSD14AQ96MC6 490 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 GAD1Q99259 594 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 MKNK1Q9BUB5 465 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 GIT1Q9Y2X7 761 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 OFD1O75665 1012 aa20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 EPB41P11171 864 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 MLH1P40692 756 aa20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 ALKAL1Q6UXT8 129 aa20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 HELQQ8TDG4 1101 aa20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 BORCS6Q96GS4 357 aa20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 HSD3B7Q9H2F3 369 aa20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 THAP9Q9H5L6 903 aa20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 MIOSQ9NXC5 875 aa20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 ARL5CA6NH57 179 aa20.27■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 SMTNL1A8MU46 457 aa20.27■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 BECN2A8MW95 431 aa20.27■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 MAPK13O15264 365 aa20.27■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 SPAG1Q07617 926 aa20.27■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 CCDC40Q4G0X9 1142 aa20.27■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 RNF214Q8ND24 703 aa20.27■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 GSTCDQ8NEC7 633 aa20.27■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 CCDC127Q96BQ5 260 aa20.27■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 UBN1Q9NPG3 1134 aa20.27■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa20.27■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
USP3-AS1-203ENST00000559737 PTGESO14684 152 aa20.27■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 DLG4P78352 724 aa20.27■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 PPP2R3AQ06190 1150 aa20.27■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 PSMD6Q15008 389 aa20.27■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 XKR4Q5GH76 650 aa20.27■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 GLRA4Q5JXX5 417 aa20.27■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 CDKAL1Q5VV42 579 aa20.27■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 CREBRFQ8IUR6 639 aa20.27■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 PARD3BQ8TEW8 1205 aa20.27■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM84AQ96KN4 292 aa20.27■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa20.27■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 CNTN3Q9P232 1028 aa20.27■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 PLAGL2Q9UPG8 496 aa20.27■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 COL4A6Q14031 1691 aa20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 DGKIO75912 1065 aa20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 IL18RAPO95256 599 aa20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 GNA14O95837 355 aa20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 SCNN1GP51170 649 aa20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 BFSP1Q12934 665 aa20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 GLB1LQ6UWU2 654 aa20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 FRMD5Q7Z6J6 570 aa20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 CASD1Q96PB1 797 aa20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 RPS6KC1Q96S38 1066 aa20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 PTPRJQ12913 1337 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 POMCP01189 267 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 NFICP08651 508 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRIM49P0CI25 452 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRIM49CP0CI26 452 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 DLATP10515 647 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 KRT13P13646 458 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 VAMP7P51809 220 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 MARSP56192 900 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 C1orf220Q5T0J3 134 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 JADE1Q6IE81 842 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 CD302Q8IX05 232 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 EFCAB13Q8IY85 973 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 TMEM130Q8N3G9 435 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC9A7Q96T83 725 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 ASB7Q9H672 318 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 TBKBP1A7MCY6 615 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 KCNJ18B7U540 433 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 INPPL1O15357 1258 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 HOXA2O43364 376 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 GJB5O95377 273 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 KCNE1P15382 129 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF18P17022 549 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 BMP8BP34820 402 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-203ENST00000559737 KCNJ12Q14500 433 aa20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms