RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555658.5

FOXN3-210, Transcript of forkhead box N3, human

TSL 3

Gene FOXN3, Length 648 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FOXN3-210	ENST00000555658	FOXE3	Q13461	319 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	FHL2	Q14192	279 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	CERS3	Q8IU89	383 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	FSD1	Q9BTV5	496 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	KATNBL1	Q9H079	304 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658		A0A0G2JLW4	131 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	ESYT3	A0FGR9	886 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	SNAP23	O00161	211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63	1e-11	■■■□□ 15
FOXN3-210	ENST00000555658	UFL1	O94874	794 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	CAPNS1	P04632	268 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	CR2	P20023	1033 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	CHRNA5	P30532	468 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	PHKA1	P46020	1223 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	GYG1	P46976	350 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	MMP14	P50281	582 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	EPHA5	P54756	1037 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	GPSM2	P81274	684 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	MAP3K12	Q12852	859 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	KLF10	Q13118	480 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	DDR2	Q16832	855 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	SPATA5	Q8NB90	893 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	SCYL1	Q96KG9	808 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	EYA3	Q99504	573 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	SPON1	Q9HCB6	807 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	NR2E1	Q9Y466	385 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	SCN7A	Q01118	1682 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	UNCX	A6NJT0	531 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	CDC14B	O60729	498 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	ZNF202	O95125	648 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	DPEP1	P16444	411 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	MCM7	P33993	719 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	MCAM	P43121	646 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	RRAD	P55042	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	RASGRF1	Q13972	1273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	SOGA3	Q5TF21	947 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	EDA	Q92838	391 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	COA1	Q9GZY4	146 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	IPPK	Q9H8X2	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	FBXO10	Q9UK96	956 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	ZNF609	O15014	1411 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	CLGN	O14967	610 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	RAD17	O75943	681 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	FGR	P09769	529 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FOXN3-210	ENST00000555658	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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