RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		12.59	□□□□□ -0.39
CS-223	ENST00000551137	STRN3	Q13033	797 aa		12.59	□□□□□ -0.39
CS-223	ENST00000551137	SLC39A14	Q15043	492 aa		12.59	□□□□□ -0.39
CS-223	ENST00000551137	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	12.59	□□□□□ -0.39
CS-223	ENST00000551137	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		12.59	□□□□□ -0.39
CS-223	ENST00000551137	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		12.59	□□□□□ -0.39
CS-223	ENST00000551137	LILRA6	Q6PI73	481 aa		12.59	□□□□□ -0.39
CS-223	ENST00000551137	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		12.59	□□□□□ -0.39
CS-223	ENST00000551137	GPR149	Q86SP6	731 aa		12.59	□□□□□ -0.39
CS-223	ENST00000551137	EDA	Q92838	391 aa		12.59	□□□□□ -0.39
CS-223	ENST00000551137	UROC1	Q96N76	676 aa		12.59	□□□□□ -0.39
CS-223	ENST00000551137	REEP2	Q9BRK0	252 aa		12.59	□□□□□ -0.39
CS-223	ENST00000551137	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	12.59	□□□□□ -0.39
CS-223	ENST00000551137	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		12.59	□□□□□ -0.39
CS-223	ENST00000551137	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		12.59	□□□□□ -0.39
CS-223	ENST00000551137	STK17A	Q9UEE5	414 aa		12.59	□□□□□ -0.39
CS-223	ENST00000551137	GDA	Q9Y2T3	454 aa		12.59	□□□□□ -0.39
CS-223	ENST00000551137	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	KIF4A	O95239	1232 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	GLUD1	P00367	558 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	PIGR	P01833	764 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	CA8	P35219	290 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	12.58	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	12.58	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	MCL1	Q07820	350 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	UPP1	Q16831	310 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	12.58	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	PDXDC1	Q6P996	788 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	USP49	Q70CQ1	688 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	GPBP1	Q86WP2	473 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	CEP120	Q8N960	986 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	12.58	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	12.58	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	EPSTI1	Q96J88	318 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	SNX27	Q96L92	541 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	ACAP3	Q96P50	834 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	FIZ1	Q96SL8	496 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	TCHP	Q9BT92	498 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	POMK	Q9H5K3	350 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	PARVG	Q9HBI0	331 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	CNTN3	Q9P232	1028 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	NR2E1	Q9Y466	385 aa		12.58	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	12.58	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	12.58	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	CIT	O14578	2027 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	MYO10	Q9HD67	2058 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	C2CD2L	O14523	706 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	FGFR3	P22607	806 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	12.57	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	12.57	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	GTF2B	Q00403	316 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	MCM6	Q14566	821 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	KYAT1	Q16773	422 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	RTP2	Q5QGT7	225 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	12.57	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	12.57	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	12.57	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	12.57	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	RABGGTA	Q92696	567 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	12.57	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	USP28	Q96RU2	1077 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	APOL5	Q9BWW9	433 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		12.57	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	CLDN3	O15551	220 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	12.56	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	TRAPPC3	O43617	180 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	TRAK2	O60296	914 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	ADRB2	P07550	413 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	CLTA	P09496	248 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	12.56	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	12.56	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	RTL10	Q7L3V2	364 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	B3GALT6	Q96L58	329 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	12.56	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	CDH22	Q9UJ99	828 aa		12.56	□□□□□ -0.4
CS-223	ENST00000551137	TBX20	Q9UMR3	447 aa		12.56	□□□□□ -0.4

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