RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 JAK2O60674 1132 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 NR3C1P04150 777 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 BRAFP15056 766 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 PSMA2P25787 234 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 SLC7A14Q8TBB6 771 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 AFAP1L1Q8TED9 768 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 FSD1LQ9BXM9 530 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 KLC2Q9H0B6 622 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 RSAD1Q9HA92 442 aa8.56□□□□□ -1.04
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PTPRB-209ENST00000550857 SPG21Q9NZD8 308 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF510Q9Y2H8 683 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa8.56□□□□□ -1.04
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PTPRB-209ENST00000550857 CEP120Q8N960 986 aa8.56□□□□□ -1.04
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PTPRB-209ENST00000550857 PGBD1Q96JS3 809 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 SPACA7Q96KW9 195 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 PDCD2LQ9BRP1 358 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 ADAM22Q9P0K1 906 aa8.56□□□□□ -1.04
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PTPRB-209ENST00000550857 B3GAT3O94766 335 aa8.56□□□□□ -1.04
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PTPRB-209ENST00000550857 SETSIPP0DME0 302 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 TAC1P20366 129 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
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PTPRB-209ENST00000550857 SH2D4BQ5SQS7 431 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 RETSATQ6NUM9 610 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 NFRKBQ6P4R8 1299 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 C4orf22Q6V702 233 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 TLE6Q9H808 572 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 TLR2O60603 784 aa8.56□□□□□ -1.04
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PTPRB-209ENST00000550857 SCRN1Q12765 414 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa8.56□□□□□ -1.04
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PTPRB-209ENST00000550857 CDC27P30260 824 aa8.56□□□□□ -1.04
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PTPRB-209ENST00000550857 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 CCDC186Q7Z3E2 898 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 SFR1Q86XK3 245 aa8.56□□□□□ -1.04
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PTPRB-209ENST00000550857 FAM129AQ9BZQ8 928 aa8.55□□□□□ -1.04
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PTPRB-209ENST00000550857 NDEL1Q9GZM8 345 aa8.55□□□□□ -1.04
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PTPRB-209ENST00000550857 MPZL3Q6UWV2 235 aa8.55□□□□□ -1.04
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PTPRB-209ENST00000550857 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 AP1B1Q10567 949 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 TEAD4Q15561 434 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 SLC27A1Q6PCB7 646 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 PCGF5Q86SE9 256 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRB-209ENST00000550857 REPS2Q8NFH8 660 aa8.55□□□□□ -1.04
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